报春花属报春花组的系统学研究

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我国是报春花属(Primula L.)的现代分布中心,有报春花属植物300多种,其中80%属于特有种,形态和生境特征非常多样,对于开展报春花属植物的系统学研究具有得天独厚的条件。报春花组(sect.Monocarpicae)以云南南部为分布中心,被认为是报春花属中可能的原始类群。厘清报春花组组间及组下的的系统位置对全面解决报春花属的系统发育关系具有重要意义。本研究全面收集了报春花组25种1变种标本,引种了18种活体材料;采用细胞学和系统发育基因组学方法,并综合形态学,试图厘清报春花组的范畴及组下系统发育关系。本文完成了32个报春花属个体的染色体数的首次报道,这些样品包括来自报春花组两个分布中心的17个种和来自鄂报春组的1个种。同时,组装了来自报春花组25个种1变种的70个样品和报春花属另外5个组的16个样品的叶绿体基因组序列,结合NCBI已公布的报春花属叶绿体基因组数据进行了比较基因组学的分析,利用叶绿体全基因组序列(Whole chloroplast genome,WP)、蛋白编码基因(Coding sequence,CDS)和基因(Gene)数据集分别构建了最大似然树(Maximum likelihood;ML)和贝叶斯树(Bayesian inference;BI),重建了报春花组的系统发育关系。本研究主要结论如下:(1)云南分布中心的报春花组物种染色体基数为9,贵州分布中心的报春花组物种染色体基数为12,两个分布中心的物种应该划分为两个不同组级别的分类群体。(2)报春花组叶绿体基因组大小在150 kb-154 kb之间,基因含量和顺序高度保守;IRs区域存在收缩和扩张现象;叶绿体基因组序列表现出适度的序列分化,一些核苷酸取代和插入缺失以及长度变异仍然存在,特别是在LSC/IR/SSC边界;与云南分布中心相比,贵州分布中心的物种具有更高的平均核苷酸多态性(Pi)和更多的高变异位点;所有高变异区均在SC区域。(3)分子系统发育分析结果高度支持云南分布中心报春花组物种和贵州分布中心报春花组物种分属两个不同的单系类群;鄂报春组中的灌丛报春和迎阳报春的系统位置出现在贵州分布中心的报春花组中。本研究推测贵州分布中心报春花组物种可能是一个新的组,建议将灌丛报春和迎阳报春归并到贵州分布中心报春花组中。贵州分布中心报春花组物种叶绿体基因组的分化程度较高,分化速率快。这可能与贵州分布中心报春花组物种在丹霞和喀斯特地貌上表现出高度的特有性分化有关。这将为探讨报春花属系统发育关系奠定基础并提供研究范例。同时,也可为进一步开展丹霞和喀斯特生境下物种形成和分化研究积累基础数据。
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