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精神发育迟滞(Mental Retardation,MR)是严重危害儿童身心健康的重大精神、神经类疾病,在人群中的患病率约为1%～3%,其病因十分复杂。诸多研究结果证明,FMR1基因的遗传变异与MR的形成有关。为了研究陕南秦巴山区柞水、安康两试验点儿童MR的发病原因,课题组在家系调查和临床检查的基础上,对这两个试验点的MR患者及其家系成员的FMR1基因的CGG重复和CpG岛的甲基化进行了检测。除发现3个CpG岛异常甲基化的患者外,并未发现(CGG)n重复序列异常扩增的个体。该结果说明,FMR1基因的CpG岛异常甲基化可能是这3个MR儿童发病的一个致病因素。已有研究表明,FMR1基因上存在多种类型的突变与MR有关。因此,在本课题组先期研究的基础上,本研究采用病例-对照的方法,在FMR1基因上选择遗传标记位点,进一步探讨在FMR1基因上其它类型的突变与陕南秦巴山区柞水、安康两试验点儿童的精神发育迟滞之间的关系。本研究以上述两个试验点的128名MR儿童、126名边缘儿童和342名正常对照儿童作为研究对象。在FMR1基因上选择三个SNPs位点rs4949,rs25714和rs25704,用聚合酶链式反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)方法进行基因分型,然后用关联分析方法对这些SNPs位点的遗传多态性与两试验点儿童的精神发育迟滞进行相关性分析。单位点分析结果显示:在女性儿童中,FMR1基因上的rs4949,rs25714和rs25704三个SNPs位点在MR组与正常对照组的基因型频率和等位基因频率的分布均无显著性差异(p=0.50和p=0.46,p=0.55和p=0.37,p=0.91和p=0.91);在男性儿童中,这3个SNPs位点在MR组与正常对照组的基因型频率和等位基因频率的分布亦无显著性差异(p=0.19,p=0.12,p=0.14)。上述分析结果说明,FMR1基因上的rs4949,rs25714和rs25704三个SNPs位点的遗传多态性均与陕南秦巴山区柞水、安康两试验点儿童的精神发育迟滞无显著性相关,提示FMR1基因除启动子区CpG岛甲基化这种突变形式之外,其它类型的突变可能与当地儿童的精神发育迟滞没有致病关系,但是,这一初步结论尚需作进一步的研究和探讨。