本文研究了一种新的文件分组加密编码方法——基于通用组合编码的加密方法，简称组合加密方法。该方法建立在组合学基础上，采用比例计算方式，它利用了通用组合编码序数的多值特性，是对通用组合编码方法的应用扩展研究。本文设计实现了组合加密编码及解码算法。组合加密编码算法的思想是根据初始密钥求解所有的密钥序列，每轮加密都先对分组序列中的数据进行全排列，形成字典空间，计算出序数，然后按规则进行拼接新序列，该轮所有组的密钥序列进行循环拼接后与新序列进行异或，奇数轮时形成的加密文件前后置换元素，经过四轮加密形成最终加密文件。组合加密解码算法就是编码算法的逆过程。在整个算法的设计实现中，本文分析了组合加密编码的技术特性确保其符合密码算法的设计准则；确定了密钥长度、分组长度和迭代轮数；实现了CPU串行的组合加密编码算法和解码算法。其中，各密钥的编排算法使用数据与位置替代的方式。在对组合加密技术中的编码算法进行优化时，论文首先对组合加密编码算法中全局最大序数的计算进行GPU并行处理；接着，对组合加密编码算法进行CPU段间并行处理；最后，对组合加密编码算法的频率表进行压缩优化。组合加密编码算法不同于已有密码算法按位加密的思想，采用码元作为加密运算的基本单位，使得组合加密编码算法中分组长度和密钥长度可以动态调整，而且组合加密编码后密文分组长度不同于明文分组，相比已有密码算法是提高保密性的又一体现，由此可见组合加密编码算法是对密码体制的一种全新的尝试，有其独特的意义。