酵母细胞中的代谢通路是相互联系又是相对独立的整体,代谢通路之间具有协同关系。基因处于这些代谢模块中,对模块的运行起着重要的作用。总的代谢模块、子模块及模块内某些特殊基因在表达水平上可能会有一些相关性,因此,研究代谢通路之间及基因与通路之间的关系,对我们获得并提高某一特定代谢产物产量有重要的指导作用。大部分细胞内蛋白质的表达水平与mRNA的量是一致的。因此,基于以上分析,本课题查阅了大量的网站信息,最后选取斯坦福大学数据库中的酵母芯片数据进行归类整理,选取每张芯片中CH1(环境变化前mRNA的量)与CH2(环境变化后mRNA的量)的值,做成了一个小型的数据库,以这个数据库为分析基础,重点研究了酵母脂类代谢模块,利用芯片数据分析了脂类模块中对模块的总基因表达量起主要作用的基因,建立了对模块表达量起主要作用基因的生物信息分析方法。另一方面,利用ORIGIN作图分析了脂类代谢13个子模块中与模块表达趋势一致的基因,发现了YHR190W和YNR008W这两个基因与所在模块表达具有一致性。这些都将为面向生产应用的基因网络改造工程提供重要的参考信息。本实验还对酵母细胞内的β-氧化基因进行了分析,初步构建了代谢γ-癸内酯的局部基因网络。通过这个方法发现了与代谢γ-癸内酯相关的潜在12个新基因,分别为ERG10、KGD1、LYS21、CIT2、ICL1、AAT1、DAL7、DAL3、ALT2、PCK1、PYC2和MAE1,对它们进行分类后发现有的基因还存在于脂类代谢以外的其它代谢模块,这预示着我们也可以从其它模块中寻找提高γ-癸内酯产量的方法。