苏州河、黄浦江是上海的两条主要河流，均被称作上海的“母亲河”，黄浦江是上海的重要水源保护地。黄浦江是“二期引水工程”和2010世博会的选址所在地，因此对苏州河、黄浦江水环境作科学、客观、真实的监测与评价显得尤为重要。本研究从2004年4月至2005年2月每两个月进行采样，共进行了6次采样，共设9个采样点。本文在苏州河、黄浦江水体理化指标监测基础之上，对两条河流的浮游植物群落结构组成和季节变化等方面进行监测和研究，利用浮游植种类组成、物群落结构、指示种、数量生物量和Shannon Wiener多样性指数等生物指标结合理化指标对苏州河、黄浦江水环境现状做了综合分析和评价。总结了苏州河、黄浦江全年各季节出现的浮游植物详细名录。提供了苏州河、黄浦江水生生物方面的研究资料，为今后的环境综合治理和评价打下基础。 1．苏州河浮游植物共计有141种，隶属于8门56属。苏州河浮游植物从数量生物量来看以绿藻门为主，其次是硅藻门。它们的月平均数量分别为119.45万个／L和97.79万个／L，其它各门浮游植物的数量较低。浮游植物数量生物量存在明显的季节变化，夏季最高，冬季最低。苏州河的优势种主要有绿藻门的二角盘星藻及其变种；硅藻门的颗粒直链藻及其变种和梅尼小环藻等共7种。 2．黄浦江浮游植物共计有244种，隶属于8门83属。浮游植物数量生物量平均值硅藻门最多为62.57万个／L，其次是绿藻门为27.49万个／L。黄浦江浮游植物中硅藻占有绝对数量优势。浮游植物数量生物量存在明显的季节变化，夏季高，春季低。黄浦江浮游植物的优势种主要有尖尾蓝隐藻、颗粒直链藻及其变种、梅尼小环藻等共7种。 黄浦江浮游植物种类数多于苏州河，均以绿藻门浮游植物种类数最多，硅藻门次之。从浮游植物数量生物量来看苏州河远远高于黄浦江，苏州河为绿藻-硅藻型，黄浦江为硅藻-绿藻型。两条河共同的优势种是颗粒直链藻及其变种和梅尼小环藻。 3．苏州河Shannon Wiener多样性指数变动范围是1.52-2.71，平均值8月份最低，4月份最高；从中上游到下游多样性指数逐渐降低。黄浦江Shannon Wiener多样性指数变动范围是2.59-3.77，平均值12月最低，2月最高，从上游到下游多样性指数均值总体上呈下降趋势。黄浦江Shannon Wiener多样性指数高于苏州河。