论文部分内容阅读
海洋环境地形复杂、生境独特，栖息着大量的微生物。研究海洋微生物，可增进人类对微生物适应海洋极端环境机制的认识，为生命的起源进化提供理论支持，并为生物矿化、生物活性物质研究提供理论依据。本文针对太平洋深海多金属结核区和富钴结壳区结核内部和外周沉积物微生物多样性进行研究，并对太平洋海隆热液区分离获得的一株菌株进行多相分类学研究。 首先，采用可培养的方法分离培养微生物。多金属结核区分离得到的136株菌株，可分为51个分类单元。富钴结壳区分离得到的54株菌株，可分为19个分类单元。多金属结核区和富钴结壳区可培养细菌主要类群为α和γ变形菌纲细菌。相比较而言，多金属结核区物种丰富度指数(ACE、Chao1)和多样性指数(Shannon)均高于富钴结壳区。本次研究发现部分细菌可能参与结核结壳锰氧化过程。此外，一些菌株与已报道菌株间的序列相似性较低，通过后续多项分类学研究表明其代表了一个新属。另外，采用非培养的方法构建结核内部及外周沉积物的16S rRNA基因文库，获得1013条细菌序列和640条古菌序列，分析了结核内部及外周沉积物的微生物多样性。1013条细菌序列可分为414个不同的细菌OTU，分为15个门，8个非培养的系统发育种群和一个未鉴定种群。所有文库的细菌主要类群是变形菌门。640条古菌16S rRNA基因序列分成31个OTU。奇古菌门是古菌中的主要类群包含21个OTU。奇古菌门主要种类是海洋古菌群Ⅰ（Marine GroupⅠ）。广古菌门(Euryarchaeota)包含13条序列10个OTU，OTU之间相似性较低。 其次，采用多相分类学的方法对一株东太平洋中脊硫化物区来源的细菌菌株进行分类鉴定。系统发育分析显示菌株22DY15T是红杆菌科的一员，但形成独立的遗传拓扑结构。同时比较菌株和参比菌株在表型、生理生化和化学成分等特征，结果显示菌株22DY15T代表了红杆菌科的一个新属(Brevirhabdus pacifica22DY15T)。研究成果丰富了东太平洋微生物的物种资源库。