一个玉米穗轴分生组织突变体表型分析和基因初步定位

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong516
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玉米是重要的粮食、饲料和工业原料,在我国国民经济中占有重要的地位。玉米穗轴发育突变会改变果穗大小、穗行数和行粒数等,从而影响玉米产量。前期的研究中,我们从自育普通玉米自交系中分离得到一个源于自然突变,稳定纯合的花序分生组织发育突变体fea*-9LB030,初步形态鉴定结果表明其性状表现与目前已报道的大多数花序分生组织发育突变体不同,虽然在部分表型上与fea2、fea3、和td1基因类似,但很多性状又有别于fea2、fea3、和td1基因,有必要对其开展深入的研究。通过对突变体的表型分析、遗传分析和突变基因的初步定位,以期将该突变基因初步定位到某段染色体区间,为下一步实现基因的精细定位和克隆奠定了基础。取得的主要研究结果如下:1、突变体fea*-9LB030性状表现为:突变体的性状表现不同于目前所报道的玉米花序分生组织发育突变体。其主要性状表现是:在雌花序中上部正常发育的穗行中常散布有额外的不完整穗行,穗行数多且不规则,导致雌花序顶部扁而宽。雄穗的主轴及分支中上部花序较野生型粗大,其上小穗对成对,呈不规则排列,密度大,有多聚小穗与多聚小花现象发生。2、本研究采用重测序BSA-seq方法对玉米的BC5F2群体的抗性极端性状材料构建30+30的混池,并进行混池测序,检测亲本间及子代混池间的SNP(single nucleotide polymorphisms,SNP)、InDel(insertion-deletion,InDel)等变异位点,获得与性状紧密关联的分子标记,SNP和InDel交集的结果:对SNP和InDel关联区域的交集取交集,共得3个与性状相关的侯选区域,总长度为18.45 Mb,关联区域内共注释到基因1,919个,其中非同义突变SNP位点的基因441个,移码突变基因111个。3、进一步验证在普通玉米自交系R18背景下突变体fea*-9LB030突变性状受一对隐性基因控制。后代BC5F2代分离群体中突变型与野生型的分离比例为1:3。4、基因初步定位结果表明:基于重测序BSA-seq分析的结果,结合SSR标记定位群体验证分析,判定该玉米突变体基因fea*-9LB030位于玉米基因组1号染色体48-53Mb之间的5Mb的遗传范围内。
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