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目的:为了明确新疆加工辣椒根腐病的病原菌种类,同时筛选出针对主要病原菌有较好防效且安全的生物及化学药剂,最终为新疆加工辣椒根腐病的防治提供技术支持。方法:从新疆巴音郭楞蒙古自治州、昌吉回族自治州、伊犁哈萨克自治州以及兵团第二师和兵团第八师等主要加工辣椒主产区采集典型辣椒根腐病病样,通过常规组织分离法对致病菌进行分离,采用形态学观察和分子生物学方法进行鉴定,并采用柯赫氏法则进行致病性测定,以明确新疆辣椒根腐病的主要致病菌。采取室内盆栽和皿内抑菌试验以筛选出防效较好的的化学和生物防治药剂,并对生防细菌的抑制机理进行研究。结果:1.从新疆巴音郭楞蒙古自治州、昌吉回族自治州、伊犁哈萨克自治州以及兵团第二师和兵团第八师等共19个加工辣椒主产区采集辣椒根腐病病害样品共211份,分离获得真菌分离物161个,其中镰刀菌121株,占总分离物的74.2%。将镰刀菌经形态学和分子生物学鉴定后,共鉴定出尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)、茄病镰刀菌(Fusarium solani)、拟枝孢镰孢菌(Fusarium sporotrichioides)、串珠镰孢(Fusarium moniliforme)、Fusarium brachygibbosum和Fusarium fujikuroi,其分别占镰刀菌总数的47.11%、19.01%、7.44%、9.09%、9.91%和7.44%。经致病性测定,尖孢镰刀菌和茄病镰刀菌可引起辣椒幼苗发病,其余镰刀菌接种的辣椒植株正常,说明新疆加工辣椒根腐病的主要致病菌是尖孢镰刀菌和茄病镰刀菌。2.室内毒力试验中的四种药剂,15%WP三唑酮EC50最小,为0.2283mg/L,80%EC乙蒜素、80%WP多菌灵和45%WP噁霉·福美双EC50分别为0.3296mg/L、2.0937mg/L和20.5687mg/L。3.室内盆栽防效试验中,施用药一周后,80%乙蒜素EC 800倍液和15%三唑酮WP 400倍液,防治效果达到77.29%和73.97%,远好于其他药剂,S44菌株24h菌悬液的防效为51.29%。施药两周后,80%乙蒜素EC 800倍液防效最好,为70.01%,其次是15%三唑酮WP,防效高于50%,S44菌株24h菌悬液防效为36.65%。施药三周后,80%乙蒜素乳油800倍液防效最好,为68.13%,S44菌株24h菌悬液的防效为41.27%,80%多菌灵WP和15%三唑酮WP的防效均低于50%。4.枯草芽孢杆菌S44抑菌机制表明,抗菌脂肽的产生是其主要的抑菌机制。结论:尖孢镰刀菌(F.oxysporum)和茄病镰刀菌(F.solani)是新疆加工辣椒根腐病的主要病原菌。80%EC乙蒜素、15%WP三唑酮、枯草芽孢杆菌S44发酵液可作为防治加工辣椒根腐病的主要防治药剂。生防菌S44的主要防病机制是产生脂肽类抗生素。