强直性肌营养不良1型骨骼肌组织中microRNA的表达及靶基因预测

来源 :中国人民解放军总医院 解放军医学院 解放军总医院 军医进修学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wkadjx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:基于前期建立的强直性肌营养不良1型(myotonic dystrophy type 1, DM1)患者骨骼肌组织microRNA表达谱,筛选出差异表达的microRNA,检测其中4个microRNA (miR-146a、miR-182、miR-200c 和 miR-885)在DM1患者及正常对照骨骼肌组织中的表达水平,同时检测与肌肉组织发育和再生相关的niR-1、miR-133、 miR-206及种子区含有CAG重复序列的miR-103、miR-107勺表达,比较其在DM1患者和对照骨骼肌组织中的表达差异,分析差异表达microRNA与DM1患者基本临床参数之间的相关性。同时利用生物信息学方法,预测差异表达microRNA的靶基因,分析靶基因的功能,为DM1发病机制中microRNA作用的研究提供新的思路和依据。方法:1)选取2012年9月至2014年6月在解放军总医院神经内科经基因检测确诊的DM1患者12例,收集并整理DM1患者的临床资料。通过肌肉活检获取肌肉标本,酶组织化学染色进行病理诊断;对照组肌肉标本取自12例无神经肌肉疾病且年龄和性别大致匹配的骨科手术患者。2)采用实时荧光定量 PCR (real-time polymerase chain reaction)技术检测病例组及对照组骨骼肌组织中microRNA(miR-146a、miR-182、miR-200c、miR-885、miR-1、miR-133、miR-206、miR-103和miR-107)的相对表达水平。3)统计学分析:利用SPSS 20.0软件,数据以均数±标准差表示,通过两独立样本的T检验方法比较病例组和对照组microRNA的表达差异,用方差分析比较microRNA的表达与临床参数之间的相关性,取双侧检验p<0.05作为判断有统计学意义的标准。4)利用生物信息学软件TargetScan、 miRanda及PicTar预测nicroRNA的靶基因,并与前期筛选出的差异基因取交集,通过GO-analysis对交集基因进行显著性功能分析,根据P值进行相关性排序。结果:1)DM1患者骨骼肌组织中miR-146a的相对表达量明显低于对照组,其差异有统计学意义(p=0.003<0.05),其他microRNA的表达在两组间均无统计学差异。DM1患者骨骼肌组织中niR-146a的表达水平与性别、病程、MIRS评分之间无明显相关性。2)利用TargetScan、miRanda及PicTar三种软件预测miR-146a靶基因并与前期实验筛选出的1950个差异基因比对,对17个交集基因做GO-analysis,根据p值(p<0.05)经过显著性筛选,结果显示交集基因主要参与神经元分化、细胞凋亡的负性调节等生物学过程。结论:miR-146a在DM1患者骨骼肌组织中低表达,但其差异水平与患者性别、病程和MIRS评分均无相关性。通过生物信息学分析,miR-146a可能通过参与神经元分化、细胞死亡等重要的生物学过程而在DM1的致病过程中发挥作用,为DM1发病机制中microRNA作用的研究提供新的思路和依据。
其他文献
我们都知道文件生命周期理论揭示了文件的运动形式,但是文件生命周期理论本质上描述的是相对于形成活动而言的文件运动形式,即由形成活动的现行文件转化为此活动的半现行文件
·卷首语·开发新能源事所必至科技:汽车发展的灵魂致读者和作者开发利用昆虫资源信息技术与信息化资旅:社会经济持续发展的基础与植物资源共栖共荣本刊编样部1.2一1 本刊编
申请公布号:CN104374766A 申请公布日:2015.02.25申请人:赵兴圣  摘要本发明公开了一种鉴定不锈钢牌号和不锈钢中锰、钼、镍元素的方法,通过将不锈钢显色液、锰显色液、钼显色
在国家食品药品监督管理总局指导下,中国食品科学技术学会与几十名包括院士、教授等在内的专家联合发布2014年国内外食品安全热点问题解读报告。报告显示,微生物污染成为2014年
目的:研究心力衰竭患者中血清胱抑素C与患者肌酐的相关性,评估血清胱抑素在心力衰竭患者预后中的临床应用价值。  方法:  1.收集从2011年1月到2014年1月于新疆医科大学第
王:我在文化部是一个算不上文化人的人,更不是名人,我曾写信请求你不要采访我,免得浪费时间,可是你还是来了.rn李:那是您谦虚,我可不敢苟同.据我所知,您老早在1935年就在邹韬
档案信息化建设是档案工作适应社会信息化发展的必然趋势,是以资源建设为核心、信息网络建设为基础、信息法规、标准为保障的一项系统工程。而“坚持以人为本,树立全面、协调
洪铁军,笔名老铁,1955年出生于哈尔滨市。毕业于北京首都师范大学书法艺术专业。现为中国书法家协会理事、中国书法家协会楷书委员会委员、中国书 Hong Tiejun, pen name ir
豫玉23号特征特性与栽培技术河南省安阳市种子公司(455000)张文英王金平1品种来源:原名安玉5号,系安阳市农科所育成的高产、优质、多抗、株型紧凑的玉米杂交种,1997年4月被河南省农作物品种审定委
以神华财务公司为例,介绍了从战略制定、战略实施、战略绩效管理3方面构建企业战略管控体系的过程,并对建立以平衡计分卡和战略地图为重要管理工具的战略绩效管理体系进行分