分工负责、互相配合、互相制约是调整我国三机关关系的原则。该原则在理论上有一定的模糊性,配合、制约的内容规定不清楚,在实践中异化为配合原则所主导三机关关系原则。配合有余,制约不足,成为三机关关系在诉讼程序中的常态。这种关系格局造成了庭审程序形式化,侦查程序未受有效制约,使得法院、检察院和法院在刑事诉讼中的关系异化,从而导致冤假错案的频发。十八届四中全会《中共中央关于全面推进依法治治国重大决定》中明确提出要优化司法职权配置,推进以审判为中心的诉讼制度改革。因此,在以审判中心的理念主导下,重新审视分工配合制约原则显得格外重要。具体来说,从宏观上来,要改变“以侦查为中心”的现状,加强庭审实质化,优化三机关关系；从微观上说,贯彻直接言词原则,完善证人出庭制度,严格执行非法证据排除制度,实现审判对侦查的程序性控制。