现代行政学研究表明，政府行政系统的行政行为及其行政功能在很大程度上会受到特定的环境因素的影响，行政系统不是一个独立于自然或者社会和经济体系之外的系统，而是与社会的各种子系统有着各种密切的关系，相互影响，相互制约。因而，任何行政系统的活动和关系的研究都不能离开一定的经济、政治、文化等环境要素，而且，只有当行政系统处于经济、政治、文化等社会环境的“生态平衡”中，政府的行政系统才能充分有效的发展和运行。北部湾经济区在建设过程中政府作为将发挥着至关重要的作用，而政府的核心就是行政系统，本文即是从行政生态的视角分析和研究北部湾经济区政府管理如何完善与改革才能使这一行政系统在社会、经济、政治、文化等社会环境因素的影响下达到相互之间的新陈代谢、物质循环和能量循环之间的平衡。文章借用里格斯的行政生态学理论以及其主要的功能——结构分析研究方法进行研究，从行政生态学的理论着手，重点介绍了一些学者在中国对于行政生态学的误解和混淆，并对相关概念进行了厘清和界定。然后，本文阐述了北部湾经济区政府管理的现状以及存在的问题，再以行政生态学的视角，主要是从行政生态学中的五大要素和三大特质着手，采用文献分析等方法对北部湾经济区政府管理中的环境和行政系统之间的相互影响进行了阐述和分析，对政府管理的改革与完善上进行分析和研究，以此为依据，对于北部湾经济区政府管理存在的困境和问题进行分析，并提出推进新的政府改革与完善的创新思路和对策建议，以补充和完善相关的研究空白，供学者研究、科学决策和实践参考，期望能对北部湾经济区的政府改革与完善以及经济发展能有所启发。