基于CRISPR/dCas的转录激活系统在水稻中的应用

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:scg5252
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CRISPR/Cas系统的发现,推动了生物学诸多研究领域的快速发展,近年来在此系统的基础上又衍生出了CRISPR/d Cas系统,该系统在基因表达水平调控方面发挥着巨大的作用。目前几种基于CRISPR/d Cas9的高效转录激活系统已被开发用于动物和人体细胞,然而d Cas9介导的转录激活在植物中的研究却相对较少且主要集中于双子叶植物拟南芥中;而且大量的工作着重于鉴定和优化d Cas9与激活结构域的融合,对于植物中启动子区域向导RNA(guide RNA,g RNA)靶位点对转录激活效率的影响知之甚少。另外,CRISPR/Cpf1系统作为新型的CRISPR/Cas系统,它的出现使得基因编辑靶位点的选择更为丰富,由于脱靶效应极低以及cr RNA结构的特异性,CRISPR/d Cpf1系统在多重基因调控方面更具优势,但是应用难度较大,很多研究也处于探索阶段。本课题从CRISPR/d Cas9入手,开展水稻中的转录激活研究。首先我们构建了第二代的d Cas9-SAM系统,并对其在水稻中的转录激活效果进行了分析,发现其激活效率不理想。因此我们又选择了在植物原生质体中被证明转录激活效率较高的d Cas9–6TAL–VP128(d Cas9-TV)系统,同时为了转录激活系统能够在水稻中高效工作,引入了水稻特异的Os U6、Os U3启动子完成了系统的优化。为了探究g RNA靶位点对转录激活效率的影响,针对靶基因Os WOX11和Os YUC1的启动子区域,在转录起始位点(Transcription Start Site,TSS)上游不同区域我们设计了一系列靶位点,并且将不同靶位置的g RNA进行了组合。我们将构建好的单靶点和多靶点的转录激活载体通过农杆菌介导的稳定转化方式转化水稻中花11诱导的愈伤组织,并根据靶基因的表达量变化来探究这种转录激活系统在水稻中的效果。此外,我们也尝试设计开发了一套基于d Cpf1的转录激活系统,使用组合突变方式将Cpf1突变为d Cpf1,然后融合Sun Tag和TV等转录激活元件,最后选择同样的靶基因转化了水稻。我们希望通过这两种方式简便快捷地对水稻的基因进行过量表达,更加方便研究水稻中的基因功能,并为今后的转录激活系统设计提供一些参考。我们的研究结果显示,d Cas9-TV转录激活系统在水稻中能够强烈上调生长素相关基因Os WOX11、Os YUC1的表达,在组培分化阶段显示出明显的根部表型;实时荧光定量PCR(quantitative Real-Time PCR,q RT-PCR)的结果也显示两个靶基因表达量上升明显,而使用d Cas9-SAM系统仅有微弱的激活效果。同样,我们也分析了靶位效应,发现当靶向区域在TSS上游350bp以内时,转录激活效率最佳;如果同时选择两个靶点靶向同一启动子,效果可能会更好。总之,我们证明了转录激活系统在水稻稳定转化中的可行性和适用性,为将来水稻的基因功能研究提供了有用的工具。
其他文献
基于Birnbaum-Saunders(BS)分布,Leiva提出拓展Birnbaum-Saunders分布.因为拓展BS分布对异常值不是很敏感,所以被用到空气污染、水污染等问题中.本文主要针对其中一类三参数的拓展BS分布(记为EBS(α,β,σ))展开研究.在实际寿命试验中,有时由于时间、财力等局限性,无法获得全样本数据,故经常选取截尾样本进行研究.本文主要讨论EBS(α,β,σ)分布的性质及截
目的:副猪嗜血杆菌病(H.parasuis)的广泛流行已给养殖业造成严重的经济损失,但在中国以及其它亚洲国家,副猪嗜血杆菌对传统抗菌药物耐药性逐年增加。本研究拟构建头孢噻呋对
亚里士多德的实现论和享乐论构成了两个哲学意义上的幸福观。亲社会行为作为一种广受关注的实现行为,很多研究都发现其对幸福感存在显著的积极影响,但是也有研究者发现亲社会行为对幸福感的积极影响并不总是存在,同样地,对于享乐行为和幸福感关系的研究结果也并不完全一致,研究者对这种幸福效应发生的条件了解不足。根据自我一致理论和人格-行为一致性理论,行为和动机取向的一致性能够预测主观幸福感,本研究探究了幸福取向中
学位
自噬是真核生物中主要的分解代谢途径,能维持细胞在胁迫条件下的稳态。程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD)是一种受基因严格调控和有序的细胞死亡事件。本实验室前期研
当前,新能源汽车电驱动系统多沿用一般工业变频调速场合的三相两电平逆变器驱动拓扑结构,其电压输出能力较差、对调速范围适应性不足、且缺少容错运行能力,难以满足高品质电
沙漠化地区植被恢复土壤的无机碳库可能是潜在的“迷失碳汇”,也是认知陆地系统碳循环过程的关键组成环节。因此,本研究选取陕北毛乌素沙地流沙地、半固定沙地、恢复年限为15
肝脏疾病在我国有很高的发病率,肝纤维化是肝脏疾病加重的一个必经过程,防治肝纤维化是防止肝脏疾病加重的有效手段。肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSC)激活后,产生Ⅰ
钢筋锈蚀是混凝土结构普遍存在的耐久性问题,钢筋锈蚀不仅影响结构的正常使用、缩短结构使用寿命,甚至直接危及结构的安全,不锈钢筋可以从根本上解决钢筋锈蚀问题。为了不锈
当今国际社会的激烈竞争,归根到底是教育和人才的竞争。人格教育旨在塑造健全完善的人格,是全面发展教育和素质教育的核心。党的十九大报告中,明确提出落实立德树人的根本任务,并且要融入教育的各个领域和阶段。初中生处于人格形成和发展的关键期,正确的教育引导具有重大意义。语文学科的人文性特点使得自身具有得天独厚的育人优势,而语文教材作为教育的载体,对健全学生人格具有不可小觑的作用。本文以部编版初中语文选文为研
学位
毛竹(Phyllostachys edulis)为禾本科竹亚科刚竹属竹种,是我国分布最广,种植面积最大,最重要的经济竹种,而笋产量是关乎毛竹产业效益的重要因素,生产中大部分笋芽始终处于休