本文探讨了睾酮在大鼠细胞色素P4502B1中的可能离去通道以及睾酮和蛋白质残基的相互作用。由于没有P4502B1的晶体结构数据，我们首先基于P4502B4的复合物晶体结构用同源模建方法构建了2B1的三维结构模型；然后将代表性的底物睾酮以利于进行化学反应的取向对接到2B1的活性口袋；最后用拉伸分子动力学的方法将睾酮“拉”出结合口袋。拉伸动力学模拟表明，在三个假定的离去通道中，位于E螺旋、F螺旋和β3转角之间的“溶剂通道”不太可能作为2B1的睾酮离去通道，而位于I螺旋、G螺旋和B′-C环区之间的通道1以及穿过B′-C环区的通道2都有可能作为睾酮的离去通道。同时我们进一步阐明了这两个通道不同的打开机理。 　　本文对P4503A4与甲吡酮的复合物晶体结构进行了常规分子动力学和拉伸分子动力学模拟。 　　本文在分析FXR与激动剂复合物晶体结构的基础上，运用虚拟筛选技术以FXR为靶标，对SPECS小分子化合物库进行了虚拟筛选，目的是为了寻找结构新颖、活性高的FXR激动剂。