中药质量控制、安全性和有效性的评价是中药现代化的三个重要方面，在第一章，简要地阐述了中药现代化的意义及其三方面的研究内容。当前，中药指纹图谱已经成为现代化学及中药现代化的重要工具之一。特别是，指纹图谱已成为国际公认的控制中药质量的最有效的手段之一。在中药指纹图谱用于中药质量控制方面，本文做了详细论述。 中药指纹图谱的测量精度十分重要，它直接影响到化学研究、中药临床疗效、实验研究，也关系到用药的安全性。目前，美国食品与药品管理局(FDA)、英国草药典、印度草药典、德国药用植物学会、加拿大药用植物学会均采用指纹图谱进行质量控制。指纹图谱的重复性和再现性是这种方法可行的重要基础。在第二章，我们将单指标的重复性和再现性精度的确定方法推广至指纹图谱情形，给出了一般性方法用于确定中药指纹图谱的重复性和再现性，并用鱼腥草数据加以说明。 中药质量评价体系的科学建立是中药走出国门、步入世界的关键性问题之一。当前，中药指纹图谱成为解决这一问题的重要工具。指纹图谱之间的相似性比较，即比较检测图谱与标准图谱之间的相似度，已经被广泛采纳并用于中药质量控制，然而，指纹图谱相似性临界值的确定一直是中药学界、化学界所困扰的难题之一。传统的方法是基于经验的基础上，对不同的中药，不同的实验检测方法，根据实验的结果人为地确定相应的临界值。这样的做法不科学、不具有一般性，带有很大的主观性，会大大影响指纹图谱相似性在实际中的运用。在第三章，我们首次将相似性临界值的确定纳入到统计学范畴，结合中药当归色谱数据，并运用bootstrap方法给出了严格确定临界值的一般方法。 中药物种之间进化关系的研究一直是中药研究中的热点问题之一。特别对于同属中药物种之间进化关系研究尤为引人注目。目前，随机扩增多态性指纹图谱(Random Amplified Polymorphic DNA，RAPD)技术被广泛应用于同属中药物种之间进化关系的研究。在RAPD指纹图谱检测中，通常选用多个引物(primer)分别进行检测。引物选取的好坏直接影响到分析结果的好坏，传统的方法并没有