随着经济全球化和区域经济一体化进程的不断加快，以及现代信息网络技术的不断进步，创新在区域经济的发展中逐渐扮演着日益重要的角色。作为经济发展的原动力，区域创新不仅是提高自主创新能力的基础，也是区域经济和社会发展的重要途径。分析研究区域创新系统的创新能力和创新绩效，及其内在驱动力，有助于认识各创新体系中存在的弱点和不足，对构建和完善我国区域创新系统，合理配置区域创新资源，促进区域创新协调发展，进而提高区域创新能力，推动区域经济发展具有重要的理论和现实意义。 结合创新能力相关理论，在对国内外现有研究成果分析和评述的基础上，针对现有区域创新能力评价方法存在的线性排序的不足，提出了区域创新能力的SVDD评价方法。该方法首先对样本数据进行了标准化处理，并利用因子分析方法对样本数据进行降维，进而利用SVDD模型实现区域创新能力的评价。针对创新能力评价结果，再利用数据包络分析方法对各区域的创新绩效进行了有效性分析，并利用投影分析，给出了创新绩效非DEA有效区域的改进方案。论文给出了上述方法的具体步骤，实证研究取得了理想的效果。