2008年6月28日,我国财政部、证监会、审计署、银监会、保监会联合发布了第一部《企业内部控制基本规范》,今年4月26日,财政部又再次会同证监会、审计署、国资委、银监会、保监会等部门发布了《企业内部控制配套指引》,至此,我国企业内部控制的规范体系终于得以规范建立。但是我国高校内部控制制度至今仍没有一套系统的规范体系,高校作为一个为社会培养高级专门技术人才,提供科研成果和服务,满足社会物质和文化方面的多种需要的载体,更需要建立健全完善的内部控制制度,才能使整个社会的教育事业健康发展。本文从内部控制相关理论入手,通过与企业对比总结出高校内部控制的特点,分析了国内高校内部控制现状,指出我国高校内部控制在控制环境、风险评估、控制活动等方面尚存在诸多问题。为解决这些问题,本文参考内部控制的理论框架和国家关于内部控制的相关规范文件,结合我国现阶段高校内部控制发展现状,侧重于从控制活动方面对高校内部控制几项主要内容进行了实务设计。最后,结合我国高校的实际情况,对我国高校内部控制工作的主要内容做出了分析,并对其内部控制的有效运行提出了改进对策和建议。