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本研究针对河北省玉米种子市场中存在的套牌现象，玉米品种审定当中出现的更换杂交种亲本问题，新品种保护中特征特性方法鉴定周期过长，提高种子生产企业纯度质量控制的技术手段等问题，采用SSR标记技术对河北省2005年以后审定的23个主要玉米品种及其自交系进行实验分析，通过以下方法完善我省品种SSR检测方法：（1）改善DNA提取方法：单粒种子及其它组织均研究出快速提取法，使用改良的玉米单粒种子DNA提取法提取玉米种子DNA。其提取的质量有较高纯度，OD260/OD280在1.8-2.0之间；（2）优化PCR扩增体系：利用现有设备，根据本实验室条件对PCR扩增体系进行优化，以达到较好的扩增效果。运用该技术构建标准样品图谱：（1）从我省近几年收集的标准样品中选取23个有代表性的、有一定市场销量的玉米品种制作标准图谱。旨在建立适用于河北省的玉米杂交种及亲本遗传真实性鉴定的指纹图谱库及技术应用体系。（2）确定适合鉴定23个品种纯度的引物。（3）初步探索分析23个品种的亲缘关系。通过对SSR技术的完善和23个玉米品种及自交系指纹图谱的构建，改善我省玉米种子市场及品种审定中存在问题，推广该技术，加强种子企业对纯度质量控制的技术手段。目前玉米DNA指纹技术已广泛应用于品种真实性及品种审定。据北京农科院玉米研究中心不完全统计，每年新审定品种数以百计，每年参加国家及省区试品种数以千计，400多个已国审品种，600多个获得品种权的品种等都采用此项技术鉴定，解决了好多因品种真实性和品种权争议的纠纷。北京、四川等省市种子管理部门已开展应用。