针对生物分子网络、生物功能、疾病的发展及治疗领域中涉及的组合调控和组合药物问题,提出一种基于分支理论的组合摄动研究方法,用于分析组合调控对系统动力学的影响。与已有的用于评价组合摄动效率的方法相比较,该方法由于不涉及系统对刺激响应的暂态动力学,所以大幅减少了计算量,简化了分析的过程,并且在生物功能调控,细胞命运决策和组合药物治疗方面有着重要的应用价值。我们运用基于分支理论的组合摄动方法调查了HBV/HDV感染在组合药物PEG-IFNα和nucleos/tide analogues治疗下的动力学演变,由此分析这两种药物在治疗中的协同调控作用,并结合实际的临床试验报道,来分析该组合药物在治疗HBV/HDV感染中所表现出来的个体差异性。本论文的主要研究内容为第3和第4部分,详情如下：1)针对生物分子网络和组合药物治疗中的组合调控问题,分析提出基于分支理论的组合摄动研究方法的实际意义及合理性,并借助于一个多稳决策模型给出基于动力学分支的组合摄动方法的理论推导和定义。同时通过分析目标函数与组合摄动之间的关系,我们也研究了组合摄动的最优组合策略。为了验证该方法的有效性和计算的简便性,我们运用此方法研究一个生物上现实的CREB模型,并与已有的组合摄动方法的结论进行比较。2)结合免疫响应机制发展了一种HBV/HDV感染模型,利用稳定性理论和分支理论分别研究了该模型平衡点的局部稳定性和模型动力学在单药物或组合药物治疗下的演变过程。运用我们所提出来的基于分支的组合摄动理论研究组合药物PEG-IFN a与nucleos/tide analogues在治疗]HBV/HDV感染中所表现出来的协同调控性,并结合免疫响应机制分析治疗中所出现的疗效个体差异。