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microRNA(miRXA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码小分子，功能上能够通过与其靶mRNA序列的3UTR结合进而降解mRNA或抑制mRNA翻译。大量的研究结果表明miRNA在生长发育，细胞增殖分化，细胞周期等过程具有重要的生物学功能。此外，许多实验研究结果已经证实miRNA与各种人类疾病密切相关，如癌症、心血管疾病、二型糖尿病等。miRNA的出现改变了研究者对RNA世界的理解，为研究者进一步探索并理解复杂疾病的发病机理提供了新的重要途径。本课题通过整合大规模的miRNA表达谱分析miRNA之间的功能协同作用。我们发现miRNA并非孤立地行使功能，而是通过紧密的功能协同网来精细的调节下游的靶基因，进而参与相关的生物学过程。通过构建不依赖于疾病与组织的miRNA基础功能协同网，我们发现调节系统发育是miRNA协同作用的核心功能。进一步，我们分析并比较了疾病状态下的miRNA功能协同网与正常状态下的功能协同网。结果表明miRNA条件依赖的功能协同网与基础功能协同网相比发生了结构上的显著变化。这些变化正是由组织特异miRNA对基础功能协同作用的重新组织所导致。疾病的发生也正是通过失活正常状态下具有重要协同作用的miRNA进而达到改变miRNA之间功能协同网中的核心元件所导致，并最终引起异常的miRNA功能协同模式。