论文部分内容阅读
黑琴鸡(Lyrurus tetrix)隶属于鸡形目松鸡科,为国家Ⅱ级重点保护野生动物,中国濒危动物红皮书易危物种。近年来,我国黑琴鸡种群数量呈显著下降趋势,黑琴鸡濒危状况日趋严重。本研究以河北塞罕坝黑琴鸡种群为研究对象,利用样线调查法查明黑琴鸡数量现状,并采用线粒体DNA控制区标记和微卫星DNA标记技术,从两个方面探讨了塞罕坝三个不同地区黑琴鸡种群的遗传多样性及与环境因子之间的相关性。
本研究发现塞罕坝地区黑琴鸡种群密度为2.20只／km2,与1990年春至1992年秋黑琴鸡的种群密度相比下降了76.9％,黑琴鸡种群密度呈显著下降趋势。黑琴鸡种群密度分布表现为:千层板林场>阴河林场>北曼甸林场>第三乡林场>三道河口林场和大唤起林场。通过线粒体DNA控制区序列研究,结果显示:塞罕坝黑琴鸡线粒体DNA控制区全序列长为1017bp,其中A、T、C、G平均的含量分别为23.7％、34.296、26.9％和15.2％,A+T与C+G含量分别为57.9％、42.1％。共检测到8个变异位点,其中简约信息位点5个,单独位点3个,包括颠换位点1个,转换位点7个,变异位点占分析序列总长度的0.77％。19个个体共确定了4种单倍型,其中H1、H2为三个地区共享的,H3、H4分别为第三乡和阴河特有的。塞罕坝地区黑琴鸡种群的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.450和0.00167,种群间和种群内遗传距离在0.0012—0.0026之间。分子方差分析结果显示:种群间和种群内均存在遗传变异,种群间的遗传变异为57.19％,种群内的遗传变异为23.79％,种群间变异大于种群内变异。遗传分化系数Fst值平均为0.2,阴河种群与三道河口种群和第三乡种群之间存在较显著的遗传分化。
本文从22对微卫星引物中筛选出10对具有高度多态的微卫星引物,10个微卫星位点在塞罕坝三个地理种群中位点的观测等位基因数为3.800—4.300,平均为4.067；有效等位基因数为3.026—3.389,平均为3.194；Shannon信息指数为1.179-1.290,平均为1.234；观测杂合度为0.383—0.500,平均为0.448；有效等位基因数为3.029—3.389,平均为3.194；多态信息含量为0.532—0.800,平均为0.708；遗传分化系数Fst值大小为0.025-0.179,平均为0.112；从Fst估计的基因流大小为1.148—9.783,平均为1.989。利用UPGMA方法对黑琴鸡种群进行聚类分析,三道河口种群(pop1)和第三乡种群(pop3)亲缘关系较近,阴河种群(pop2)与其它两个种群关系较远。通过线粒体DNA控制区标记和微卫星DNA标记两种方法,分别对塞罕坝黑琴鸡种群的遗传多样进行分析,其结果基本一致。通过对黑琴鸡遗传多样性与环境因子相关性分析,结果显示:森林郁闭度、植被覆盖率和斑块面积与核苷酸多样性具有显著的正相关,相关系数分别为r=0.844(p<0.05)、r=0.923(p<0.01)、r=0.922(p<0.01),斑块面积、森林郁闭度、植被覆盖率是影响黑琴鸡核苷酸多样性的环境因素。