基于全基因组单核苷酸多态性的遗传力估计的方法研究

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随着对基因领域的深入研究和不断探索,人类对复杂性状和常见病的研究逐步深入到了全基因组的研究中.而单核苷酸多态性SNP在这些研究中起到了重要的作用.SNP是可遗传变异中最常见的一种,并且它广泛地分布在某些群体、个体全基因组DNA中,大约每1000个碱基出现一个SNP.正是由于SNP的分布广泛、遗传相对稳定、对基因的表达水平或蛋白质结构有很大影响的性质,对于全基因组SNP的研究已经应用到生物学、遗传学等诸多领域.一直以来,像糖尿病、高血压、冠心病等复杂疾病一直困扰着我们.由于99%的人类基因与老鼠非常相似,所以科学家用老鼠的实验去研究影响复杂疾病的性状.本文主要对和复杂疾病(糖尿病、高血压、冠心病)相关的四个性状进行遗传力大小的估计,用288只NMRI老鼠的真实性状表型值和SNP基因型,通过线性混合模型,应用方差分析估计的方法对HDL、CHL、TRI、GLU这四个性状进行遗传力估计.并用逐步回归和次等位基因频率MAF进一步对染色体和SNP位点筛选.结果表明,通过逐步回归和MAF变量筛选,对遗传力估计结果的贡献最大的致病位点的基因频率范围和MAF<0.1的SNP是一致的.
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