婴幼儿血管瘤患者血浆中环状RNA表达谱鉴定及功能分析

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研究背景:婴幼儿血管瘤(Infantile hemangioma,IH)是婴幼儿期间最为常见的皮肤良性肿瘤,目前的研究认为其发病率在4.5%左右。IH的生长通常在前3个月迅速增加,尤其是在5-8周的生命期内,在3个月时会长到最终大小的80%左右。尽管大多数IHs无需治疗即可自然消退,但大约10-15%的IHs会导致并发症,如压迫重要器官、溃疡或毁容,需要干预。IH是血管生成和血管形成障碍所导致的后果。然而,是什么引发了它的发展仍然是一个有争议的问题。因而,IH发生发展的分子机制有待于深入研究。环状RNA(circRNA)是由外显子转录而构成的非编码RNA。近年来,人们发现了 circRNA的多种功能,其中包括承当小分子RNA海绵,基因表达可以通过调节剪接或转录以及与RNA结合蛋白相互作用来被影响。另外,circRNA还具有作为诊断性和预测多种疾病预后生物标志物的潜力。有学者研究发现在血管生成和与血管发育相关的生物过程中也有circRNA的影子。然而,对IH患者血浆circRNA的系统评价从未被报道。鉴定circRNA在增生期IH患者血浆中的表达,阐述并探索其可能涉及的功能及调控机制,以便于完善circRNA在IH中的调控网络。研究目的:本研究通过微阵列芯片检测和生物信息学分析的方法,比较增生期IH患儿血浆与正常健康儿童外周血中circRNA的表达水平,并进一步探索与血管瘤发生发展相关的circRNA的功能差异及相关调控位点,从而完善非编码RNA在IH中的调控网络及发病机制。研究方法:该研究得到山东省立医院伦理委员会的批准。根据严格的纳入及排除标准,收集2018年5月到2019年4月期间于山东大学附属山东省立医院整形外科就医的增生期血管瘤患儿血浆标本和正常健康儿童血浆共17对,转至-80℃保存,用于芯片检测及PCR验证。采用Arraystar Human circRNA V2 Array检测3对增生期IH患者血浆及正常健康患者血浆circRNA表达谱。R语言limma包对数据进行处理。通过t检验方法得出差异倍数>1.5且P<0.05的被认为有统计学差异。差异表达的circRNA通过绘制散点图、火山图及聚类图来表现。CircRNA在17对增生期IH血浆中的表达用实时荧光定量PCR技术来进行验证。利用Primer 5.0设计出circRNA特异性背靠背引物,将GAPDH设为内参基因。采用GO和KEGG通路富集分析探索差异circRNA的生物功能及调控通路,利用Cytoscape 构建 circRNA/miRNA/mRNA 调控网络,并用 SRAMP 预测 circRNA的m6A修饰位点。研究结果:本研究发现128个差异表达的circRNA,其中72个表达上调,56个表达下调。其中,hsacircRNA101566、hsacircRNA103546、hsacircRNA103573 这 3 个下调的 circRNA 经 RT-qPCR 验证。GO 和 pathway分析显示,其靶基因与血管生成、肿瘤形成和进展有着密切关联。基于这些结果构建出circRNA/miRNA/mRNA调控网络。此外,这三个circRNA共发现7个m6A修饰位点,其中4个属于hsacircRNA103573,其中1个具有很高的可信度。结论:本研究率先报道了从IHs患者血浆中分离到的circRNA谱,为国际首例对IH患者血浆的circRNA研究。本研究筛选出128个差异表达的circRNA,其中72个表达上调,56个表达下调。然后,通过RT-qPCR检测3个下调的circRNA(hsacircRNA101566、hsacircRNA103546、hsacircRNA103573)。通过 GO和pathway分析探讨了不同表达circRNA的作用。本研究预测hsacircRNA101566所参与的调控网络及信号轴可能对IH发生的分子机制产生影响。然而,还需要进一步的研究来阐明其参与的实际功能以及详细调控机制。
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