ERCC2/XPD基因多态性与结直肠癌易感性的关联性研究

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目的:探讨DNA损伤修复基因ERCC2/XPD的rs13181G/T及rs1799793A/G单核甘酸多态性位点与结直肠癌易感性之间的关系,希望能在分子水平上为结直肠癌的诊断与治疗提供一定的理论依据。方法:选取2012年2月-2013年2月间就诊于河北医科大学第四医院的211例结直肠癌患者和132例健康人群做病例-对照研究。采用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取白细胞中DNA,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法对ERCC2/XPD的rs13181G/T及rs1799793A/G两SNP位点等位基因基因型频率分布进行检测。实验数据使用SPSS19.0版软件包(SPSSCompany,Chicago,Illionis,USA)进行统计学分析。对直肠癌组、结肠癌组和对照组年龄之间差异进行t检验;并分别对两组的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率进行χ2检验。并利用Hardy-Weinberg对两个组别基因型频率的分布进行连锁平衡分析。使用logistic回归方法计算相对风险度的比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidenceinterval,CI)。采用EH软件和2LD软件对MMP-12MMP-13基因rs2276109A/G和rs2252070A/G两位SNPs行联合分析,P <0.05作为差异有显著性的标准。结果:1应用Hardy-weinberg定律对rs13181G/T及rs1799793A/G在对照组人群的基因型频率进行遗传平衡检测,结果P>0.05,说明该人群符合遗传平衡法则,具有代表性。2ERCC2/XPD rs13181多态G、T等位基因在直肠癌病例组和对照组中的频率分别为31.11%、68.89%和17.8%、82.2%,两组相比,其P <0.05,有统计学差异;ERCC2/XPD基因rs13181多态的G、T位点的等位基因在结肠癌病例组和对照组中的频率分别为28.68%、71.32%和17.8%、82.2%,其P值为0.02,有统计学差异。在对照组和结肠癌病例组中, GG、GT、TT基因型频率分别为:6%、23.48%、70.45%和16.18%、25.00%、58.82%,两组相比,其P小于0.05,有统计学差异。通过OR分析,与TT基因型相比GG基因型增加了结肠癌的发病风险,OR=3.179,95%CI=1.196-8.546。在直肠癌实验组和对照组中, GG、GT、TT基因型频率分别为:18.18%、25.87%、55.94%和6%、23.48%、70.45%,两组相比,其P小于0.05,有统计学意义。通过OR分析,与TT基因型相比GT和GG基因型增加了直肠癌的发病风险,OR=2.72,95%CI=1.08-6.86及OR=3.77,95%CI=1.62-8.81。3在结肠癌病例组与对照组中,rs1799793A/G的A、G等位基因频率分别为16.2%、83.8%和15.15%、84.85%,两组相比,其P值为0.77,无统计学差异。在直肠癌病例组与对照组中,rs1799793A/G的A、G等位基因频率分别为17.83%、82.17%和15.15%、84.85%,两组相比,其P值为0.42,无统计学差异。在结肠癌病例组和对照组及直肠癌病例组中,GG、GA基因型的频率分别为:67.65%、32.35%和69.7%、30.3%及64.34%、35.66%,经χ2检验,其P值分别为0.872、0.345,均无统计学差异。通过OR分析,与GG基因型比较,GA基因型与直肠癌、结肠癌的发病风险之间均无明显关联(OR=0.784,95%CI=,0.473-1.299和OR=0.909,95%CI=0.485-1.706)。4在结肠癌病例组中rs13181G/T和rs1799793A/G之间存在连锁不平衡关系(D’=0.492),其中在正常健康组出现频率最高的单体型是rs13181T-rs1799793G(69.7%),其次为rs13181T-rs1799793A(24.2%)、rs13181G-rs1799793G(6.1%)和rs13181G-rs1799793A(0%)。单体型为rs13181G-rs1799793G者可增加结肠癌的发病率(OR=1.421,95%CI=1.210-3.954),rs13181T-rs1799793G单体型则可减少结肠癌发病风险(OR=0.523,95%CI=0.362-0.941),rs13181T-rs1799793A单体型可能与该病发病风险无关,而rs13181G-rs1799793A单体型可能是由于样本数量小,对照组单体型漏检。在直肠癌病例组中这两位点间存在连锁不平衡现象(D’=0.021)。人群中rs13181T-rs1799793G单体型则可减少直肠癌发病风险(OR=0.523,95%CI=0.354-0.972),单体型为rs13181T-rs1799793A、rs13181G-rs1799793G者可增加直肠癌的发病率(OR=1.783,95%CI=1.060-2.997)及(OR=1.231,95%CI=1.423-2.8)。结论:1ERCC2/XPD基因rs13181G/T位点的多态性可能与我国北方地区结直肠癌易感性相关,与TT基因型相比GG基因型增加了结肠癌的发病风险,GT和GG基因型增加了直肠癌的发病风险。2ERCC2/XPD基因rs1799793位点的多态性可能与我国北方地区结直肠癌易感性无明显相关。3在结直肠中ERCC2/XPD基因rs13181G/T及rs1799793A/G两个位点之间存在连锁不平衡现象。
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