农业是国民经济的基础,“三农”问题的解决直接关系到国计民生,是社会稳定发展的保证。要根本上解决“三农”问题,增强农业发展的竞争实力,进一步促进农业的转型、调整和适应现代化社会经济发展的需求,就必须大力发展高等农林教育,尤其是提高农业大学的科技创新能力,培养高层次、高水平的农业人才,实现农业高层次技术成果的推广和产业化。地方农业大学作为重要组成部分,将进一步为区域乃至全国的经济与社会发展做出突出贡献。本文依据科技投入与产出体系的研究方法,对“十一五”以来赣湘两省农业大学的科研活动进行了比较分析。通过对两省农业大学科技投入与科技产出成果比较分析后得出结论：通过国家长期的“三农”政策影响,两所农业大学的科研活动都有较大的提升与发展,科技投入增加,科技产出增多,创造了较显著的经济与社会效益,形成了良好的科技投入与产出发展机制。江西农业大学的科研活动在总体上要弱于湖南农业大学,在科研人员的科技产出效率上却占有一定优势。结合江西省和江西农业大学的实际情况,对江西农业大学的科技投入与产出活动做了SWOT分析：江西农业大学办学历史悠久,传统学科教学和科研能力强,利用社会企业投入多等方面的优势。但是也有政府政策和资金倾斜力度不足,科研经费投入不足,科研成果转化机制不够健全等方面的劣势。在新的国家社会大背景下,江西农业大学的科技活动面临着机遇与挑战并存的局面,加大国家和地方政府政策的倾斜及资金的投入,构建有效的科研成果转化体系,是推动学校科技投入与产出质量提升的重要保证。最后,依据江西农业大学的实际情况,提出了进一步促进科技投入与产出可持续发展的建议。