医药行业长期以来保持较高增速，在国民经济中占据重要位置。当前在中国医药健康产业政策利好,行业新版GMP改造的背景下，医药龙头生产企业纷纷进行新生产基地的投资和建设。然而，通过调查研究发现，现实中估测化学制剂类医药项目（本文简写为：HY类项目）现金流和折现率的方法很多是不正确的，存在非理性行为。通过查阅文献，暂时还没有发现针对HY类项目投资决策变量估测的研究。因此，本文基于行为财务理论对HY类项目投资决策中现金流及折现率的估测进行研究，具有重大的现实意义。本文首先采用调研访谈法，调查了现实中10个医药项目，访谈了15位广州某大型医药集团的决策部门、财务分析部门及实施部门的相关人员，收集了HY类项目的投资特点、风险的具体表现、决策指标的选择、现金流量构成及估测方法、折现率取值及依据等情况，总结归纳出现实中现金流及资本成本估测过程中的非理性行为。然后通过对比分析选择更具操作性和更高准确性的现金流估测方法和资本成本估测方法，运用直接法设计出HY类项目现金流估测表，基于BAPM估测出HY类项目的资本成本。最后将设计出的HY类项目现金流估测表应用于BS医药项目的现金流估测，利用估测出来的资本成本，计算出BS医药项目的净现值及内部报酬率，并与传统方法计算结果进行对比分析。本文通过研究发现： HY类项目的8种具体风险属于非系统性风险，但对项目影响较大，可通过现金流调整来体现其对价值的影响；HY类项目现金流估测过程中常见的有9种非理性行为，资本成本估测过程中常见的有3种非理性行为。本文还设计出HY类项目期初、期中、期末的现金流估测表，方便其他项目参考使用。本文还发现，现实中HY类项目折现率的取值集中在10%-15%这个范围；而本文基于BAPM估测出HY类项目贝塔为0.5530，从而得出HY类项目资本成本为8.93%，与研究团队的其他成员研究结论较为一致，可作为HY类项目投资决策中的折现率。本文最后将设计出的HY类项目现金流估测表和资本成本的计算结果应用于BS医药项目，利用EXCEL的NPV和IRR函数计算出BS医药项目的净现值为26291万元，项目的内部报酬率为13.19%。与传统方法的计算结果进行对比，发现由于传统方法折现率取值为12%，包含了非系统性风险；以及将利息支出7030万元计入增量现金流，期末未考虑回收无形资产终结值3762万元的增量现金流，因此导致净现值与本文计算结果差异32803万元，差异率为56.59%。由此可见，由于传统方法存在非理性行为，导致其计算结果与本文方法的计算结果差异较大，因此对估测HY类项目的现金流及折现率的传统方法进行改进是非常有必要的。综上所述，本文得到更符合现实情况及更具操作性的HY类项目现金流及资本成本的估测方法，可为其他HY类项目投资决策提供参考，以提高决策质量。