五运六气理论是我国古代研究自然气候变化规律与生物适应度关系的理论,它是结合了天文学、气象学、生物学、历法学、医学、物候学等多种学科的学说。该理论以天干地支为推演的工具,分析运与气和气候变化的关系,由此推导出疾病发生的规律。五运六气理论是中医基础理论的核心,古人说：“不读五运六气,检遍方书何济”。可见,运气理论在中医界有崇高地位。本文将从以下三个方面对运气理论的基本概念及其与气候变化、疫病爆发的相关性进行分析：(1)运用气象数据对“运”的特点进行分析。“运”的分析在《内经》中占据重要地位,然历代运用五运六气理论于临床的医家临证往往主要考虑六气、特别是客气因素,鲜及中运和客运,且中运、客运与气象变化的相关研究亦少。本文通过选取全国具有60年(1954-2013)完整气象数据的129个气象站点,将之分为华东、华北、东北、西南、中南、西北六个地区,从整体和局部对年积温与中运的关系作分析,发现尽管不同站点地域差异很大,但寒温特征趋势与运存在稳定关系,可与《内经》相关论述互相印证,说明对运的研究很有必要,可为更好地认识运气理论实质提供数据支持,同时为临床治疗拓展应用思路。(2)分析六气变化与疫病发病的关系。《内经》中的《六微旨大论》、《气交变大论》、《六元正纪大论》等篇章重点描述了“气”的特点,比如“气”的盛衰、承制等规律,但多是从哲学层面上分析。本文通过对近60年气象数据的统计分析,发现“气”在数据上的规律性变化以及“气”变化与疫病的发病符合《内经》中的哲学性描述,说明从数据角度分析“气”与疫病爆发的特点,有助于把握疫病发病规律,为医家临证提供更准确的参考。(3)中医对疫病爆发的预警预测是建立在运气理论的基础之上,其核心是“三年化疫”理论。本文以SARS疫情、埃博拉疫情、H7N9禽流感疫情、登革热疫情为例,结合气象数据和运气理论,探讨运气理论在疫病分析中的应用,利用运气理论阐释疫病的变化规律,并建立疫病爆发预警预测机制。