我国博士后的科研产出包括发表论文的数量与质量、承担课题的数量与质量、申请专利的数量等几个方面。本文通过建立一个分析博士后科研创新能力的框架,选择几个易于用论文来衡量科研产出且较为热门的学科(生物学,材料科学与工程,信息通信与工程)作为研究对象。论文的评价指标包括论文的数量和论文的质量两个方面,博士后科研创新能力的比较主要是基于这两个方面展开的。并从论文的视角对影响博士后的三个因素即跨学校,学科流动和团队合作精神进行了方差影响分析。其结论是:博士后阶段发表文章的数量虽然比博士阶段少,但从发表论文的质量来看,博士后阶段被中文核心期刊和SCI收录的文章数量的比例却略高于博士阶段。从外部影响因素看:从“985”学校流动到“非985”学校做博士后更有利于创新人才科研创新能力的发挥;跨学科比没跨学科的博士后更有效地提高了科研创新能力;博士后阶段的团队协作精神更加增强了。最后,论文针对博士后制度存在的问题提出了相关的政策建议。