国家“十一五”规划提出了“健全区域协调互动机制，形成合理的区域发展格局”的重大工作目标，并将国土空间划分为优化开发、重点开发、限制开发和禁止开发四类主体功能区。其中，优化开发区域是指国土开发密度已经较高、资源环境承载能力开始减弱的区域。国家提出“优化开发区域”，一是要改善生态环境，二是要其承担引领全国经济社会的发展和我国参与经济全球化的功能。然而，由于缺乏完善的空间协调机制，这类地区的经济发展水平在提高的同时，空间发展的矛盾和冲突也在加剧，严重制约了区域整体竞争力的提升，削弱了走向国际竞争和全球化的主体功能。因此，优化开发区域要根据资源环境承载能力引导人口分布、经济布局、国土利用和城镇化格局，促进人口、经济、资源、环境的空间均衡，规范空间开发秩序，形成合理的空间开发结构，就必须探索新的空间协调机制。 主体功能区概念的提出引发了人们对新的空间协调观的思考，如何将这一具有深刻意义的理论内涵转化为具有实践意义的政策措施成为迫切需要解决的问题。首先，主体功能区视角下的空间协调需要有思维转变和理论创新。在空间协调的思维转变方面，从“注重经济增长”到“注重生态环境”、从刚性规定到刚柔并重、从注重GDP到注重人均GDP，都体现了空间协调的新思想。在空间协调的理论创新方面，主体功能区在非均衡中实现均衡，较好解决了公平和效益的统一问题，创新了均衡和非均衡发展理论；体现了尊重客观规律，谋求人与自然和谐的发展理念，在经济与生态之间找到了平衡点，丰富了生态经济学的理论内涵；在空间结构理论方面，反映了经济空间和自然生态空间的融合。因此，在区域空间结构的认识上开创了新的思维。另外，在区域调控理论方面，注重从“产业”调控到“空间”调控。其次，优化开发区域要实现优化需要形成高效的区域空间，包括有一个高级的产业结构、是一个优化的产业空间、有一个合理的集聚空间、具有高效的网络空间、高度开放的制度空间，以及使区域具有持续发展能力的生态空间。 珠江三角洲地区开发密度已经较高，资源环境承载能力开始减弱，是全国最重要的优化开发区域之一，承担着重大责任和发展功能，但自身结构却存在很多问题，许多问题非常典型，具有很强的代表性。目前珠三角在空间协调机制方面存在协调机制体系不完善、区域规划达不到实际效果、行政区域间利益冲突协调不理想等问题。因此，在构建空间协调机制时应该以主体功能区规划为基础，以相关行为的法律化和制度化为保障，依托各种政府和民间的协调机构，综合运用政策、规划、经济等手段，实现区域空间的协调。具体包括：①从形式和内容方面进一步完善空间协调机制体系；②为充分体现区域规划的实际意义，建立以主体功能区规划为核心的规划机制；③为发挥政府的调控能力，促进资源的空间优化配置，建立符合优化开发区域主体功能的政策机制；④为解决行政区之间的矛盾和利益冲突，健全不同层次和类型的跨地区协商机制；⑤为有效保护生态环境，完善区域的生态补偿机制。 同时，要有效发挥协调机制的作用，最终实现空间的协调，政府需要采取一些具体的措施，主要包括：①在更大空间尺度考虑空间协调问题；②构建区域空间发展新格局；③明确产业空间协调的政策取向；④借鉴发展权转移的理念维护区域主体功能；⑤实行多层级空间管治；⑥健全法律保障。