生物标记物作为新兴的古海洋古环境研究手段，在南海的应用还比较薄弱。本次工作选择南海北部陆坡MD05-2904(19°27.32N，116°15.15E，水深2066 m)沉积柱状样进行生物标记物分析，对26万年来的古表层海水温度、海洋初级生产力、浮游植物群落结构及源区植被的变化进行探讨。 利用长链不饱和烯酮获取的26万年来古表层海水温度(SST)，整体趋势与本柱的浮游有孔虫G．ruber的氧同位素曲线变化一致，最低温度21.5°C(LGM，末次盛冰期)，最高温度达28.3℃(MIS5.5期，海水氧同位素)。MD05-2904记录的特点是：Uk37SST和北极冰芯、底栖有孔虫δ18O记录变化相似，而浮游有孔虫δ18OG．ruber却和石笋、邻近孔浮游有孔虫的δ18O记录相似。这是因为δ18OG．ruber受季风强烈的区域性影响，如受降雨、河流淡水输入引起的盐度变化等；而Uk37SST更多地反映全球性的变化。与SPECMAP曲线相比，本站位MIS3初、6初和7.4期氧同位素偏轻，可能主要与夏季风增强，降雨、河流淡水输送增加，海水盐度降低有关；MIS5.5期氧同位素偏重，可能与此时降雨减少，蒸发增大，导致海水盐度增大有关。在千年尺度上，MIS4、3和2期的SST高分辨记录，显示出可与北极冰芯对比的D/O、Henrich事件。 在陆源生物标记物中，长链正构烷烃、正构醇总量(含量和堆积速率)具有明显的冰期高、间冰期低，冰阶高、间冰阶低的趋势，这主要由海平面变化控制。烷烃参数CPI， ACL和C31/C27都有冰期高的趋势，与南海北部的抱粉记录有较好对应，这些参数可能反映冰期时源区植被的草本植物相对增加，而非温度的增高或降低。获取的部分碳同位素结果也显示冰期时烷烃的δ13C变重，表明C4草本植物增加，与烷烃参数结果一致。烷烃含量、堆积速率，CPI， ACL及C31/C27比值，在MIS3期末，都有显著的高值，乃至峰值出现。显示这是一个特殊时期，说明东亚夏季风增强使此时的南海北部陆地区比较潮湿，植被茂盛，低大气CO2有利于源区植被草本含量增加，而同期的低海平面，使河流运输加强，烷烃物质被迅速搬运沉积。以上这种推测可以在将来的研究中利用更多的参数，尤其是烷烃的碳及氢稳定同位素测定而加以验证，因为后两者都与降雨及植被种类(C3或C4)有关。 对海洋初级生产力标记物的研究表明：海洋初级生产力有明显冰期高，间冰期低，冰阶高，间冰阶低的趋势。这种趋势证明冰期时表层海水的营养盐含量增加，最有可能是由于东北季风增强，使表层海水混合加强，把中层水的营养盐输送到表层。与浮游动物的相关性分析表明，虽然颗石藻在沉积物中的含量高，但主要的浮游植物群很可能为硅藻和沟鞭藻。陆源物质(营养盐)输入对本区的海洋初级生产力影响大，黄绿藻尤为明显。通过太阳辐射量、陆源物质与海洋初级生产力的交叉频谱分析，认为太阳辐射量在长期尺度上起调控作用，海洋初级生产力对应营养盐变化的反应更为直接。约130 ka时无论是浮游植物生产力还是群落结构都发生重大的变化，颗石藻在群落中的比例显著下降，而硅藻、沟鞭藻显著上升，有可能主要反映了海平面及陆源营养盐供应的变化。