传统的企业绩效审计往往以单一的财务指标作为企业绩效评价的标准，但面对企业日益复杂的内外部经营环境，这些财务指标已经难以伞面反映企业的绩效情况，并且常常在企业的绩效审计中起着错误的指导作用。而基于平衡计分卡的企业绩效审计能够在保留财务指标的同时，引入客户、内部业务流程和学习与成长等方面的评价指标，将财务指标与非财务指标、短期指标与长期指标、定量指标和定性指标相结合，从企业的战略、市场、持续发展能力等多方位、多角度对企业经营活动的经济性、效益性和效率性进行审计评价，以此弥补传统绩效审计的缺陷。 本文首先对绩效审计和平衡计分卡的相关基本理论进行论述。在指出和分析我国目前绩效审计存在不足的基础上，针对平衡计分卡作为一种综合业绩衡量和战略实施的工具，从其出发点、职能、因果逻辑关系、所蕴含的战略管理和平衡思想等方面分析了平衡计分卡应用于企业绩效审计的可行性。 其次，由于绩效审计作为一种高层次的审计活动，面临着诸多的难点。对此，本文在对现行评价指标作简要介绍并指明其不足的基础上，对基于平衡计分卡思想的绩效审计指标的建立进行了探索。在指标设计方面，本文把绩效审计分为财务、客户、内部业务流程和学习与成长四个方面，构建出平衡计分卡绩效审计指标体系的结构框架，并在平衡记分卡原有指标的基础上对这四个方面的指标进行了细化，以增进在实际应用中的可操作性。 最后，本文结合平衡计分卡思想对传统绩效审计的流程和报告制度进行了尝试性的改进，以配合平衡计分卡绩效审计在企业中的实施，并且以S电气(公司的绩效审计实例对平衡计分卡在绩效审计中的应用进行了分析和说明。