果蝇心脏候选基因CG3295敲除品系的鉴定

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本实验室利用生物信息学并结合分子生物学技术,克隆出了果蝇心脏发育候选基因CG3295。生物信息学分析结果表明:果蝇基因CG3295位于2号染色体的5789-5789区段,且只有一个外显子,具有一个转录本,其cDNA全长是1860bp,开放阅读框(ORF)全长1298bp,总共编码432个氨基酸。本实验室已经利用心管突变表型分析技术、整体胚胎原位杂交技术、成体水平的心率衰竭和胚胎抗体染色技术分析初步确定了CG3295的功能是与心脏发育有关的。为了研究CG3295的生物学功能,我们利用果蝇中独特的P转座子敲除技术,成功构建CG3295基因敲除系。通过大群体的基因敲除法筛选出了20个致死系。为了鉴定果蝇心脏候选基因CG3295敲除品系是否敲除成功,主要从以下三个方面鉴定:首先通过western blot蛋白检测法可以从蛋白上检测敲除品系,然后通过PCR进一步检测敲除品系,最后通过敲除品系的表型观察检测。首先建立20个CG3295敲除品系的通体绿色荧光品系,然后根据非通体荧光挑选出CG3295纯合子作为蛋白检测实验材料,提取纯合子的蛋白进行western blot蛋白检测,根据实验结果挑选出CG3295完全跳出品系,结果显示7,8,9,12,16号敲除品系蛋白不表达,说明这五个品系成功敲除了CG3295基因。然后根据P因子插入位点设计引物,对20个CG3295敲除品系进行PCR分析,CG3295敲除品系与野生型相比,除了目的带外还有多余的一条带,这样进一步验证了7,8,9,12,16号品系是敲除品系。最后建立CG3295敲除品系的心管绿色荧光及绿色通体荧光品系,观察纯合子CG3295的表型,结果显示副心肌出现缺失及紊乱的现象。筛选出CG3295敲除品系为研究CG3295基因在心脏发育中的作用奠定了基础。
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