农业是一个国家或地区发展的根本保证,对于我国这样一个农业大国来说,农业生产水平发展的高低、快慢将直接影响着整个社会的发展水平。在我国长期的农业发展过程中,存在的问题也日益凸显出来,尤其是农业发展过程中的环境问题更应当引起关注。为了顺应党的十八大报告中新型农业发展的要求,我们必须不断地改善传统的农业发展方式,把生态建设和环境保护纳入新型农业发展体系中,提高我国农业环境发展的效率。本文的研究思路是：首先,在综述国内外有关农业环境效率研究文献的基础上,确定本文的研究方向和分析方法；其次,根据实际情况选取适当的模型以及按照指标选取原则选取指标,建立评价体系,进行我国农业环境效率的实证分析,对求解结果进行分析,并分别进行横向和纵向分析,同时对东部、中部和西部地区进行对比分析；最后根据分析得出的结果提出提高农业环境发展效率的相关合理政策建议。主要的研究结论：在不考虑环境因素时,我国1997-2012年各地区的农业环境效率均值不是太高,其中以东部地区的农业环境效率均值最高,中部其次,西部最低,大量的投入冗余和产出不足以及农业环境污染面源的产生(主要包括CODcr、TN、TP)是效率低下的主要原因；而在考虑并剔除了环境因素之后,我国各地区的农业环境效率都有了显著地提高,其中提高最多的地区为西部地区,提升了24.3%,这表明我国农业环境效率受环境因素的影响比较严重,其中就包括自然灾害、农村家庭纯收入、文化水平以及政府支农等方面。因此,在以后的农业环境发展过程中,不但要注重产出中的农业环境面源污染,还要更加关注农业环境发展的环境因素,逐步改善和调整我国农业环境发展现状,形成和构建良好的农业环境发展联动机制,更好更快的发展农业环境经济,提高整体农业环境效率。