云南人群MTHFR基因多态性与乳腺癌易感性相关研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:g56410029uoyuhao1995
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[目的]本实验课题把疾病分为不同亚型,将传统组织病理分型和基因分型相结合,研究云南人群中MTHFR基因多态性与乳腺癌易感性、遗传、侵袭性之间的关系,为乳腺癌的早预防、早诊断及个体化治疗提供重要的科学和临床依据。[方法]1.研究共收录490例于2012年1月至2015年11月在昆明医科大学第三附属医院病理确诊BRC患者及相应的无病对照,样本年龄20-75岁,云南籍贯,在云南居住3代及以上。收集相应的人口学资料和临床资料;对照组收集人口学资料。2.取lmlEDTA抗凝空腹全血,用美国Promega公司生产的全血DNA提取试剂盒提取DNA,应用NanoDrop 2000c检测提取DNA浓度及质量,保证其浓度不小于40ng/ul。3.采用高通量时间飞行质谱生物芯片系统检测实验对象MTHFR的单核苷酸多态性(SNP),以分析乳腺癌患者(N=490)和健康对照人群(N=490)中MTHFR全段位点基因多态性与乳腺癌的易感性、发展及预后之间有无关联。4.对乳腺癌患者MTHFR各位点基因型与乳腺癌肿瘤大小、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人表皮生长因子受体2 (Her-2)表达情况的分布频率进行比较。5.通过比较乳腺癌实验组与正常对照组人口学特征,BRC各亚型的临床特征和实验室指标及各等位基因分布频率的差异,计算OR值及95%CI,从而比较不同基因型与BRC发生发展及预后的相对危险度。[结果]1.本研究分别纳入490例乳腺癌实验组及正常对照组,实验组年龄48.01±9.86岁,对照组年龄49.92±16.11岁,实验组和对照组之间年龄分布无显著差异(P=0.065);2.本研究选择检测MTHFR5’ -3’ UTR和编码区上的连锁和功能SNP位点的基因型表达情况,结果共检测出18个相关位点的基因型表达情况,如表2.1所示为两组样本各位点基因型频率分布符合哈迪温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)(PHWE>0.005),两组样本具有群体代表性;3.发现在实验组和对照组之间rs56221660 (-1662A>G)位点G等位基因和A等位基因分布存在差异(P=0.013),差异有统计学意义;4.在实验组与对照组之间,rs1801133 (677G>A)(P=0.01<0.05)和 rs56221660(-1662A>G)(P=0.01<0.05)两个位点基因型分布存在差异,差异有统计学意义;5. rs1801133 (677G>A)位点检测出 GG/GA/AA 三种基因型,rs56221660(-1662A>G)位点检测出 GG/GA/AA 三种基因型,而 rs1801131 (1298T>G)位点检测出GG/GT/TT三种基因型;6. rs1801133 (677G>A)的GG和AA基因型增加乳腺癌罹患高血压和糖尿病的风险;亚型分析中发现同样会增加Luminal-B型乳腺癌患者罹患高血压的风险;7.在Luminal-B型乳腺癌患者中,携带rs1801133 (677G>A)的多态性这一组患者初次诊断乳腺癌的年龄偏大,提示我们携带rs1801133 (677G>A)基因多态性会增加年龄大于48岁的女性患Luminal-B型乳腺癌的风险,而乳腺癌的发病率与初潮年龄和是否绝经没有相关性。8. rs1801131 (1298T>G)的GG和GT基因型是具有癌症家族史的女性患三阴性乳腺癌的风险因素,提示我们有癌症家族史的女性应警惕这一风险因素;9. rs1801131 (1298T>G)的G等位基因会增加患Luminal-A型乳腺癌患者的肿瘤早期进展的风险,而与乳腺癌的远处转移和复发没有明显相关性;10.在乳腺癌患者中,rs56221660 (-1662A>G)的G等位基因增加了患右乳癌的风险,提示我们rs56221660 (-1662A>G)的多态性与乳腺癌原发肿瘤的位置有相关性;11.在HER-2过表达的乳腺癌患者中,rs56221660 (-1662A>G)的G等位基因与患者的体重指数(BMI≥25kg/m2)有相关性;12.对所有的乳腺癌实验室指标进行分析后,我们发现三阴性乳腺癌患者中,rs56221660 (-1662A>G)基因多态性与谷丙转氨酶和谷草转氨酶水平有相关性。[结论]在此项病例对照研究中我们发现,MTHFRrs1801133 (677G>A)和rs56221660 (-1662A>G)位点基因多态性与乳腺癌易感性有相关性。rs1801133(677G>A)的GG和AA基因型是BRC患者并发高血压和糖尿病的危险因素,rs1801133 (677G>A)基因多态性增加年龄大于48岁的女性患Luminal-B型乳腺癌的风险。rs1801131 (1298T>G)的GG和GT基因型是具有癌症家族史的女性患三阴性乳腺癌的风险因素,并且会促进Luminal-A型乳腺癌患者肿瘤早期进展,而与乳腺癌的远处转移和复发没有明显相关性,提示rs1801131 (1298T>G)位点是影响Luminal-A型乳腺癌预后的重要因素之一。rs56221660 (-1662A>G)位点的多态性与乳腺癌原发肿瘤的位置有相关性,有待进一步的研究证明,并且该位点多态性可以评估BRC患者的脂质代谢和营养状况。
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