手性药物的生物活性与其立体结构密切相关。目前新药研究的一个发展趋势是研制和生产光学纯的药物，因此在药物研发中的手性药物分析己成为分离化学领域的热点和难点。毛细管电泳技术以其高效、快速、分离模式多、试剂消耗量小等优点受到众多分析化学工作者的特别关注，现已成为手性药物分离中有效分离分析手段之一。在毛细管电泳手性分析时，通常是将手性选择剂加入缓冲液中构建手性分离环境。在分离过程中由于不同构型的对映体与手性选择剂的相互作用不同，导致不同对映体的迁移速率不同，最终获得分离。本研究以环糊精及其衍生物和大环抗生素作为手性选择剂，分离和测定了多种手性化合物，对手性分离的理论和方法作进一步的研究和探讨，取得以下创新性成果：1．创建了联烯酸类轴不对称化合物的手性分离方法。2．创建了高灵敏度的利伐斯狄明的手性分离方法。3．创建了快速高灵敏度的酸性药物和氨基酸快速手性分离方法。4．创建了亚叶酸非对映异构体的高效快速分离方法。5．结合大体积进样电堆积技术，创建了痕量对映体分离方法。6．创建了一些的新手性化合物分离方法。本论文共分为七部分。第一章：以手性选择剂的种类为基础，综述了毛细管电泳手性分离的方法、理论及其应用进展。第二章：以环糊精及其衍生物为手性选择剂，以胶束电动色谱为分离模式成功的实现了联烯酸类轴不对称化合物的对映体分离。在本实验中通过对分离条件如：环糊精的种类和浓度，有机添加剂的浓度，胶束的浓度，缓冲溶液的pH和离子强度的优化，使得七种联烯酸化合物均获得基线分离，且在方法验证时得到令人满意的结果。另外我们把此方法用于非对映异构体的ee％值测定，测得结果为99.65％。第三章：以高度磺化的β-CD为手性选择剂，在弱酸性条件下实现了碱性化合物利伐斯狄明的对映体分离和高灵明度检测。为了抑制解离后的碱性化合物在毛细管内壁的吸附，我们利用中性聚合物线形聚丙烯酰胺（LPA）对毛细管内壁进行动态涂层修饰，成功的抑制了电渗流，避免了利伐斯狄明在毛细管内壁的吸附，提高了分离效率。在最佳分离条件下，利伐斯狄明对映体获得基线分离，检测灵明度比以前报道方法提高了1.6倍，且准确的对实际样品进行了ee％值测定，测定结果为99.14％。第四章：建立了一种有效的高灵敏度的，以万古霉素为手性选择剂的酸性对映体分离方法。在本实验中我们利用中性聚N，N-二甲基丙烯酰胺（PDMA）对毛细管内壁进行动态修饰，有效地抑制了电渗流，减小了万古霉素在毛细管内壁的吸附，提高了分离效率。并且该涂层具有很好的耐用性，一次涂层后连续一百次分离未见明显的功能损失。另外，利用部分填充技术，成功的避免了缓冲溶液中强紫外吸收的万古霉素对分离检测灵敏度的影响。在最佳条件下，七种FMOC衍生后的氨基酸和两种非甾类消炎药酮基布洛芬和非诺洛芬，均在4.2 min之内获得基线分离。第五章：以万古霉素为手性选择剂在PDMA涂层的毛细管中，成功的实现了亚叶酸非对映异构体的手性分离。为了提高分离效率，我们对有机添加剂和手性选择剂万古霉素的浓度，缓冲溶液的pH值和离子强度，分离电压和温度对分离度和分离效率的影响进行了详细的考察。在最佳分离条件下，亚叶酸非对映异构体在7.5 min内得到了很好的分离，并且利用高-低进样技术准确测定了杂质含量为0.08％的左旋亚叶酸样品。第六章：在第四章的基础上，利用大体积样品堆积进样技术，成功地实现了低浓度的酸性手性化合物的堆积和手性分离。在实验过程中，以非诺洛芬为模型化合物，考察了样品填充长度、电动进样时间和样品浓度对检测灵敏度、分离度等分离结果的影响。单一对映体的最低检测浓度为3.75×10^-7g／L（375 ppt），与直接进样分离对比，检测灵敏度提高了1.1×10^-5倍。最后将此方法用于低浓度的FMOC衍生后的氨基酸的对映体分离，获得满意的结果。第七章：创建了一些新手性化合物的毛细管电泳手性分离方法。