人类疱疹病毒8型ORF26亚型与新疆Kaposi肉瘤的相关性研究

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目的: 1.明确新疆KS感染HHV-8 ORF26基因亚型的分类; 2.初步探讨ORF26基因亚型与新疆KS不同临床分型及侵袭性的相关性。 方法:使用传统的酚-氯仿-异戊醇方法对新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科从1996年到2007年收集的32例KS石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA抽提;然后使用巢式PCR方法对抽提的DNA进行ORF26基因片段的扩增,扩增产物在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,并在凝胶成像系统下观察电泳结果从而确定ORF26基因阳性标本;然后对ORF26基因阳性标本的DNA进行双向测序;再采用DNASTAR软件把双向测序结果装配成重叠群;然后使用Clustal W软件对该重叠群进行核苷酸序列比对,再采用PHYLIP软件包对比对结果进行系统发生学分析,从而确定HHV-8 ORF26基因的亚型分类;最后运用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析。 结果: 1.32例新疆KS标本中经PCR检测有30例标本HHV-8感染为阳性,阳性率为93.75%。其中,共有6例AIDS-KS标本,经检测HHV-8感染均为阳性,阳性率为100%; 2.基于ORF26基因进行系统进化树分析:30例KS感染的HHV-8 ORF26基因分为两种亚型:A亚型和C亚型,其中17例为A亚型,13例KS为C亚型(其中12例为C2亚型); 3.6例AIDS-KS有3例为A亚型,3例为C亚型; 4.30例HHV-8阳性的KS中有10例标本伴有粘膜损害,其中5例为A亚型,5例为C亚型; 5.新疆KS感染的HHV-8各病毒株ORF26基因核苷酸序列(333bp)间的差异性为0~2.16%,其中,A亚型和C亚型病毒株ORF26核苷酸序列之间的差异性为0.91%~2.16%(平均差异性1.99%);ORF26基因A亚型之间核苷酸序列差异性为0-1.52%(平均差异性为0.76%),C亚型之间核苷酸序列差异性为0-0.30%(平均差异性为O.15%); 6.HHV-8 ORF26基因不同亚型与KS患者粘膜损害的相关性经统计学分析无差异性;A亚型和C亚型HHV-8感染的KS患者粘膜损害率分别为29.41%和38.46%; 7.新疆经典型KS和AIDS-KS患者感染HHV-8 ORF26基因不同亚型的差异性经分析无统计学意义。 结论: 1.新疆KS患者感染的HHV-8具有一定的特殊性; 2.新疆KS患者感染的HHV-8 ORF26基因亚型属于A亚型和C亚型; 3.新疆KS患者感染的HHV-8 ORF26基因不同亚型与KS临床类型无关; 4.新疆KS患者感染的HHV-8 ORF26基因不同亚型与KS粘膜侵袭性无关。
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