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我国东北地区是盐渍化土壤的主要分布地区之一,研究植物的耐盐能力也成为东北地区作物的研究热点之一,植物可以通过提高其耐盐能力来维持正常生长、增加作物产量。甜菜M14品系,由于其在二倍体栽培甜菜的染色体组的基础上附加了一条野生白花甜菜的染色单体,因此作为一个特殊的甜菜种质资源,甜菜M14品系是发掘甜菜优质基因资源和蛋白资源难得的材料。RNA-seq技术作为第二代测序技术的代表,可以在没有模式植物全基因组信息的条件下快速准确的进行转录组测序。本研究首次基于RNA-seq技术,利用Illumina测序平台,并结合升级版“表达谱”测序技术,对0、200、400mM NaCl处理下的甜菜M14品系的叶与根进行转录组测序,构建了1个“参考转录组”数据库和6个“表达谱”数据库。结果如下:1.通过对0、200、400 mM NaCl处理下的甜菜M14品系叶与根的RNA样品混合测序,构建了甜菜M14品系的“参考转录组”数据库,去除低质量及接头序列后共获得了54,089,906条clean reads,其中碱基质量大于20(Q20)的占据总体碱基的97%以上,通过拼接组装,得到了54,843个Unigenes,平均长度663 nt,N50值为1141 nt。2.测序得到的参考转录组中所有Unigenes通过与NCBI非冗余数据库、GO(Gene Ontology)、COG(Clusters of Orthologous Groups)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes)分别进行比对而得到功能注释,共33,542个Unigenes得到了注释。注释Unigenes富集到25个COG功能注释和121个KEGG代谢通路注释。3.分别对0、200、400 mM NaCl处理下的甜菜M14品系叶与根的RNA样品进行“表达谱”测序,构建了6个“表达谱”数据库。在0 mM、200 mM、400mM NaCl处理下叶片中分别得到10,591、10,613和10,636个经“表达谱”测序后有注释的Unigenes;0 mM、200 mM、400 mM NaCl处理下根部中分别得到10,708、10,620和10,698个经“表达谱”测序后有注释的Unigenes。4.采用RPKM法计算基因表达量,确定FDR≤0.001和倍数差异在2倍及以上(|log2(B-RPKM/A-RPKM)|≥1),且RPKM≥10的经“表达谱”测序后Unigenes为盐胁迫下甜菜M14品系差异表达基因,并对其进行了生物信息学分析。分析包括:GO功能注释和KEGG代谢通路注释。这些注释结果为我们提供了有价值的信息,有助于研究盐胁迫下甜菜M14品系中一些关键物质合成与代谢的过程、功能及路径。5.在甜菜M14品系“表达谱”数据库中随机选取与植物耐盐相关,并且NaCl处理与0 mM NaCl处理相比表达量变化明显的20个差异表达基因(BADH、NAS、HRGP、LchAB、60S、EDR、EF-HAND、SOS、GR、TIP、PIP、LRR、WRKY、RAC、LEA、SEC、MET、LTP、SOD、MYB)进行荧光定量PCR,验证差异表达倍数;根据差异表达基因的功能和代谢途径,构建了盐胁迫下甜菜M14品系叶与根中的代谢网络,为进一步研究盐胁迫下甜菜M14品系的耐盐机制奠定基础;同时选择参与ROS清除系统的12个(AOX、APX、CAT、DHAR、GOX、GPX、GR、GST、MDHAR、PRX、SOD、TRX)差异表达Unigene进行荧光定量PCR验证相关基因在代谢途径中的表达倍数差异。