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毕氏肠微孢子虫是一种常见的人兽共患肠道病原体,可导致免疫缺陷者和免疫功能低下者急性致死性腹泻。目前,基于毕氏肠微孢子虫核糖体DNA内部转录间隔区(ITS)基因位点,在230多种宿主中鉴定出至少500个基因型,其中,猪源毕氏肠微孢子虫有120多个基因型,多数存在人兽共患性,猪被认为是人感染毕氏肠微孢子虫的主要传染源之一。新疆地理生态环境丰富多样,有关该地区猪毕氏肠微孢子虫的调查研究尚较少。本研究采用PCR法对新疆部分规模化猪场毕氏肠微孢子虫进行检测与鉴定,掌握其流行情况和基因型分布特征。1.收集阿克苏某场香猪粪便样本44份,基于ITS基因位点,采用PCR法检测其DNA样本,发现18份呈毕氏肠微孢子虫阳性,感染率为40.9%(18/44),断奶前和断奶后仔猪感染率分别为100%(9/9)和32.1%(9/28),成年母猪未发现感染,不同年龄段猪的毕氏肠微孢子虫感染率统计学差异极显著(P<0.01)。鉴定出5个基因型,分别为EbpA(n=1)、EbpC(n=13)、Peru8(n=2)、MJ12(n=1)和1个新基因型(命名为XJP-I,n=1)。种系发育分析显示,5个基因型均属于组群1。结果显示,该场香猪毕氏肠微孢子虫感染率较高,存在人兽共患基因型。2.分别收集新疆沙雅县、阿拉尔市、巴楚县、叶城县、拜城县、昌吉州和若羌县的7个规模化猪场共801份猪粪便样本,基于ITS基因位点,采用PCR法检测其DNA样本,发现389份呈毕氏肠微孢子虫阳性,总感染率为48.6%(389/801),沙雅县的猪毕氏肠微孢子虫感染率最高,为73.0%(73/100),阿拉尔市的猪感染率最低,为20.0%(19/95),不同地区规模化猪场猪的毕氏肠微孢子虫感染率统计学差异极显著(P<0.01)。断奶仔猪、未断奶仔猪、育肥猪和成年母猪的毕氏肠微孢子虫感染率分别为77.2%(271/281)、35.5%(60/169)、67.4%(87/129)和11.3%(25/222),不同年龄段猪的毕氏肠微孢子虫感染率统计学差异极显著(P<0.01)。鉴定出15个基因型,13个为已知基因型,包括CHC5(n=2)、CS-1(n=5)、CS-4(n=20)、CS-9(n=1)、CS-7(n=3)、D(n=17)、EbpA(n=129)、EbpC(n=168)、EbpD(n=5)、H(n=2)、PigEb4(n=12)、PigEBITS5(n=19)、WildBoard8(n=3)和2个新基因型(命名为XJP-II,n=2;XJP-III,n=1)。上述基因型中,有6个基因型(CS-4、D、EbpA、EbpC、H和PigEBITS5)在人体内发现。种系发育分析显示,15个基因型均属于组群1。结果显示,新疆地区规模化猪场猪普遍感染毕氏肠微孢子虫,以人兽共患EbpA和EbpC为优势感染基因型,提示猪可能作为人感染毕氏肠微孢子虫重要的传染源。3.基于微卫星(MS1、MS3、MS7)和小卫星位点(MS4)位点,采用PCR法对18份香猪源毕氏肠微孢子虫阳性样本进行扩增,分别扩增出15个、12个、14个和11个样本,有10个样本在4个位点同时成功扩增,形成了8个多位点基因型,其中,基因型EbpC形成了6个MLGs,基因型MJ12和EbpA各形成1个MLG。结果显示,该场香猪源毕氏肠微孢子虫存在遗传多样特点。综合以上结果,表明新疆地区猪常见感染毕氏肠微孢子虫,其基因型存在多样分布特征,以人兽共患基因型为优势感染基因型,提示猪可作为人感染毕氏肠微孢子虫的潜在感染来源。研究结果为我国毕氏肠微孢子虫的相关研究提供基础数据资料。