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该研究应用RAPD技术对贵州山羊种群基因组DNA进行多态性分析.筛选出适合山羊的最佳PCR扩增体系.用180条随机引物对黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、南江黄羊和波尔山羊共6个种群的基因组DNA进行扩增.扩增产物以1.5﹪琼脂糖凝胶(含0.5mg/L EB)电泳分离,紫外线下检测.结果27条引物扩增得到了多态片段,每条引物的多态频率在20.00﹪~80.00﹪之间.这27条引物共扩增得到281条带,平均每条引物获得的扩增带数为10.41条.在281条扩增带中,多态带为115条,总的多态频率为40.92﹪.进一步将具有多态性的27条引物分别对15份贵州白山羊个体DNA、15份贵州黑山羊个体DNA和15份黔北麻羊个体DNA进行扩增.用Nei氏公式计算种群之间及种群内遗传距离指数及遗传相似性指数,NJ法构建系统发育树状图.结果表明,贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊和南江黄羊之间的遗传距离指数较小(其大小在0.0605~0.0904之间),尤其是贵州白山羊与贵州黑山羊之间的遗传距离指数最小,仅为0.0605.黔东南小香羊与贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊和南江黄羊之间遗传距离指数较大,而波尔山羊与以上各山羊种群间的遗传距离指数最大.NJ法聚类结果表明,所研究的山羊种群可分为6个类型,即贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、南江黄羊、黔东南小香羊和波尔山羊.贵州白山羊与贵州黑山羊首先聚在一起,亲缘关系最近;黔北麻羊、南江黄羊先后与它们相聚在一起,表明四个山羊种群之间亲缘关系较近;以后依次是黔东南小香羊和波尔山羊聚上去.遗传相似性指数表明,贵州白山羊品种内个体间与贵州黑山羊品种内个体间的遗传相似性指数都较高,黔北麻羊的遗传相似性指数较低,平均分别为0.9156、0.9023和0.8634.表明贵州白山羊与贵州黑山羊都具有较高的遗传稳定性,黔北麻羊遗传稳定性低于贵州白山羊和贵州黑山羊.