目的：观察复方苦参结肠溶胶囊治疗溃疡性结肠炎(UC)患者的临床疗效及探寻其治疗机制。　　 方法：选择34例溃疡性结肠炎患者，随机分为两组，中药组和西药组：中药组22例使用复方苦参结肠溶胶囊治疗，西药组12例使用柳氮磺吡啶治疗。两组均治疗8周。观察比较两组治疗前后的症状、体征、血常规、尿常规、大便常规、血沉、肝肾功能、心电图、结肠镜和病理检查等结果。并采用免疫组化方法即链霉菌抗生物素蛋白—过氧化物酶连结法检测两组治疗前后的κ基因结合的核因子p65(NF-κ Bp65)　　 及信号转导和转录激活因子6(STAT6)的活化及表达情况。　　 结果：中药组临床疗效总有效率为100％，西药组为75％(P<0.05)；中药组结肠粘膜病变疗效总有效率为90.9％，西药组为75％(P<0.05)。两组患者治疗后NF-κ Bp65及STAT6的表达均降低，中药组与西药组比较其差异有统计学意义(P<0.05)，且中药组优于西药组。　　 结论：复方苦参结肠溶胶囊能有效地缓解和改善患者的临床症状和体征，促进结肠粘膜病变的恢复，不但疗效明显，而且不良反应较少，溃疡性结肠炎患者耐受性较好。复方苦参结肠溶胶囊抑制NF-κ Bp65及STAT6的活化及表达可能是其治疗溃疡性结肠炎的疗效机制之一。