本文旨在从新经济地理和演化经济学的视角，深入阐述区域主体和空间经济组织运行机理，并由此探讨了区域经济的微观基础问题，这对于区域经济政策的制定和执行有着重要意义。 无论是区域经济发展还是经济空间演化，都需要明确的实施主体，区域经济政策也是以区域主体的空间活动为基础而实现。那么，究竟什么是区域主体?区域主体是怎样形成的?经济空间演化与发展和区域主体行为存在怎样的关系?这种关系在空间上又体现为什么样的机理?本文的研究就是力求从理论上对上述问题作出回答。 论文通过明、暗两条线索构建了区域主体形成及演化的一般理论框架。其中，明线揭示了区域主体的产生、演化和区域经济自组织的微观机理，隐含线索则展现了从地理空间到经济空间形成的路径和过程。总体框架共计十章，可以分为四大部分。 第一部分包括第一章和第二章，是全文理论框架展开的铺垫和基础。第一章是本文的导论，阐明选题的意义、研究思路、研究方法及主要创新之处，概括性地描述了论文的核心思想。为了保证论文有一个内在一致的研究基础，在第二章中，我们对空间经济的基本特征加以界定。研究认为，空间经济具有非均质、规模报酬递增、不完全竞争以及多重演化均衡等特点。所以，研究分析区域主体行为必须遵循这些规律。在解决了研究的逻辑基础后，本章还对区域主体的概念、特征以及我国区域主体演进的历史脉络进行了分析。 第二部分包括第三章和第四章，揭示了区域主体形成的内生过程。第三章使用新兴古典经济学模型，主要解决在一个原初状态的地理空间中，区位主体如何随着分工与专业化的深入而产生。这一章研究具有明显的演化色彩，随着分工演化，区位主体实现了分异，市场逐渐形成、完善，在这种背景下，地理空间的经济演化也就开始了。第四章深入研究了区位主体的区位选择如何诱致区域主体形成。本章构建了从区位选择到聚集经济再到多主体互动的研究路线。分析表明，区位主体虽然和区域主体在形式上相同，但是其行为和分析却有很大的差异。从区位主体到区域主体伴随着两种现象：第一，聚集经济的形成，第二，空间组织网络的形成。从方法上讲，区位选择理论大都是单元式隔离分析研究，而区域主体更强调多目标决策和空间相互作用，这实际上就是经济空间开始形成的重要标志。 第三部分是论文的理论核心，包括五、六、七、八四个章节内容，主要分析了区域主体空间行为和空间经济自组织问题。其中，第五章是对空间经济自组织的一般规律和理论进行阐述，目的是为下一章构建基于区域主体互动的空间自组织模型奠定基础。第六章研究居民和厂商两主体的空间经济自组织。这一章的研究通过经典的核心——外围模型和垂直联系模型剖析了空间经济自组织内在演化机理。第七章和第八章集中分析了地方政府这一特殊区域主体的行为及其对空间经济自组织机制的影响和作用。第七章针对追求福利最大化的地方政府行为进行研究。将地方政府的行为纳入空间视角分析并研究其与区域经济自组织的关系是本章特色。追求福利最大化的地方政府在实现其目标函数时会面临难以克服的困境，手段和目标的矛盾必然会出现，这一矛盾的结果是使地方政府从追求地方福利最大化的“社会人”变异为追求自身利益最大化的“经济人”。第八章对“经济人”假设下的地方政府行为进行研究，并提出相应的纠正方案——建立双目标、有限经济人的地方政府。双目标、有限经济人的地方政府假说认为，地方政府应该面临双重不同层面的目标函数。第一层面是以地方福利最大化为目标函数，面临的约束条件是地方要素资源约束、技术和社会条件约束以及资金约束等；第二层面是以地方可支配收入最大化为目标函数，除了面临资源、技术等约束外，还会面临空间自组织规律约束、有效行政行为约束等。 第四部分包括第九章和第十章，这是论文理论和应用的回归。第九章是从一个新的高度对本文研究框架所涉及的核心问题进行梳理，希望能够起到进一步深化的作用。该章将以自组织机制为基础的空间演化概括为从地理空间向经济空间转变的“创生”和基于重新整合形成的一体化新空间两种形式。第十章是本文的结论，提炼了全文的核心观点并指出了不足和进一步研究的方向。