目的:了解上海部分地区儿童感染幽门螺杆菌(Hp)的cagA、vacA、iceA的基因亚型,探讨其与儿童上消化道疾病的关系。　　 方法:收集2007年5月至2008年1月在该院行胃镜检查确诊幽门螺杆菌感染59例患者的胃黏膜组织,分别进行聚合酶链反应(PCR)检测cagA、vacA和iceA基因,病理检查了解胃窦黏膜炎症程度,酶联免疫吸附试验(ELISA)检测胃窦黏膜IFN-γ和IL-4的含量。　　 结果:cagA基因单独检出率为64.9％(37/57),vacAs1/m1单独检出率为19.3％(11/57),vacAs1/m2单独检出率为40.4％(23/57),iceA1单独检出率为63.2％(36/57),iceA2单独检出率为19.3％(11/57),8.8％(5/57)的菌株iceA1和iceA2均阳性,不同基因型菌株在慢性胃炎和消化性溃疡中的检出率无统计学意义。cagA型菌株在轻度、轻.中度、中度慢性胃炎中的检出率分别为66.7％、52.9％、72.2％,vacA s1/m1型菌株在轻度、轻-中度、中度慢性胃炎中的检出率分别为19％、11.8％、27.8％,vacA s1/m2型菌株在轻度、轻-中度、中度慢性胃炎中的检出率分别为47.6％、29.4％、38.9％,iceA1型菌株在轻度、轻-中度、中度慢性胃炎中的检出率分别为71.4％、47.1％、72.2％,iceA2型菌株在轻度、轻-中度、中度慢性胃炎中的检出率分别为9.5％、35.3％、16.7％,不同基因型菌株与胃窦黏膜炎症的严重程度无关。不同基因型菌株感染的胃窦黏膜IFN-γ、IL-4的含量亦无统计学差异。　　 结论:cagA+/vacAs1/m2/iceA1为上海部分地区儿童中幽门螺杆菌的优势基因型。除了菌株因素外,宿主基因多态性、环境因素对于疾病的发生、发展也发挥了重要作用。