不结球白菜自交不亲和相关基因克隆和S单元型的鉴定

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不结球白菜杂种优势明显,自交不亲和是不结球白菜杂种优势利用的一种重要途径。本研究结合亲和指数法和限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法,利用不结球白菜SRK基因的多态性对不结球白菜的自交不亲和性及S单元型进行鉴定研究,同时对材料的SLG基因和SRK基因片段分别进行了克隆分析,并利用荧光定量PCR技术分析SLG基因和SRK基因的表达。为不结球白菜自交不亲和性杂优利用、了解SLG和SRK基因在十字花科中的进化、不结球白菜自交不亲和性机理的研究奠定基础。1.依据甘蓝SRK基因保守序列设计SRK特异引物并进行验证,通过PCR-RFLP法分析16份不结球白菜自交系材料的SRK基因的多态性,根据其差异对不结球白菜S单元型及自交不亲和性进行研究。结果表明:16个不结球白菜自交系SRK基因共产生6种不同的带型,其中有1个是强自交不亲和系,4个是弱自交不亲和系,且与田间测定的亲和指数相符,从而说明利用SRK基因的多态性鉴定不结球白菜纯合自交系的自交不亲和性和S单元型是可行的。同时对部分材料的SRK基因的核苷酸序列进行分析验证,表明相同类型SRK基因序列一致性较高,且SRK基因存在明显的单核苷酸多态性,为进一步自交不亲和性的研究奠定了基础。2.以不结球白菜自交不亲和系为材料,采用RT-PCR技术,用特异引物对SLG基因进行克隆,获得SLG基因cDNA序列长度为1324 bp,命名为BcSLG。序列分析表明:所获得的不结球白菜BcSLG基因cDNA序列包含一完整的编码框,编码432个氨基酸,含有12个保守的半胱氨酸残基和7个N-糖基化位点。序列比对和系统进化分析表明:BcSLG与其它植物的SLG基因氨基酸序列具有较高的同源性,与大白菜和甘蓝亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明:BcSLG基因在自交不亲和系的柱头中表达量最高,其次是花蕾,叶片中表达最低,在自交亲和系的柱头、花蕾和叶片中相对表达较低。3.采用PCR和RT-PCR技术,分别以不结球白菜自交不亲和系的基因组DNA和柱头cDNA为模板进行克隆,获得的SRK基因片段长度分别为964bp和644bp。序列比较分析表明:所得不结球白菜SRK基因的DNA和cDNA序列分别与大白菜、甘蓝和油菜等SRK基因具有较高的序列相似性,SRK基因的激酶域序列包括4个外显子和3个内含子,且3个内含子剪切位点符合经典的GT-AT规则。荧光定量PCR分析结果表明:不同材料的不同组织中SRK基因的表达水平存在显著的差异,SRK基因主要在自交不亲和系的柱头中高度表达,在自交亲和系中该基因的表达主要分布于叶片、花蕾和柱头组织中。从而表明SRK基因是自交不亲和反应的雌性专一决定因子。
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