基于核rDNA的ITS及cpDNA的psbA-trnH序列的中国枣属植物的系统发育

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 16次 | 上传用户:kathy052
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枣属(Ziziphus Mill.)是鼠李科(Rhamnaceae)中最具经济价值的一个属。枣属的近代分类学研究可追溯到18世纪初,但一直以来在枣属分类问题上比较混乱,曾有40种,60种,100种等多种说法,枣属属下分类系统是否自然尚未可知。基于此,本研究对原产我国的枣属12种及一个外类群种,通过对核rDNA ITS序列及cpDNA的psbA-trnH序列直接测序法,在分子水平上重建枣属植物的系统发育。并对适合硅胶干燥的枣属植物叶片DNA的提取方法进行了比较。 1.以硅胶干燥保存15天和半年的枣属植物叶片为试材,分别采用简易CTAB法、高盐沉淀法和高盐低pH法3种方法提取枣属总DNA,通过A260/A280和琼脂糖凝胶电泳对提取的总DNA进行鉴定。半年内不同保存时期提取的DNA没有差异;高盐沉淀法效果最好,所得DNA纯度高。 2.枣属的ITS(包括5.8S)序列总长度为601~611bp,长度变异小,仅相差10bp,种间序列遗传距离为0.331~10.000%,与外类群间的遗传距离为14.919~17.944%。以Paliurus spina-christi Mill.为外类群,运用PAUP4.0软件进行的系统发育分析表明:Z.pubinervis Rehd.、Zapetaia Hook.、Z.fungii Merr.与Z.jujuba Mill.、Z.acidojujuba C.Y.Cheng et M.J.Liu组成一个姐妹群;Z.xiangchengensis Y.L.Chen et P.K.Chou、Z.montana W.W.Smith、Z.mairei Dode与Z.incurva Roxb.、Zrugosa Lam.组成另一个姐妹群;Z.mauritiana Lam.和Z.attopensis Pierre.各为一个单系群。除外类群外Z.attopensis Pierre.位于整个系统树基部,可能是与外类群亲缘关系最近的类群。 3.枣属的psbA-trnH序列总长度为305-344bp,长度变异大,相差39bp,种间序列遗传距离为1.384~6.885%,与外类群间的遗传距离为3.947~6.587%。以P.spina-christi Mil.为外类群,运用PAUP4.0软件进行的系统发育树分析表明:Z.mauritiana Lam.、Z.mairei Dode、Z.xiangchengensis Y.L.Chen et P.K.Chou、Z.montana W.W.Smith、Z.rugosa Lam.与Z.fungii Merr.、Z.apetaia Hook.形成一个姐妹群,靴带支持率为92%;Z.attopensis Pierre.和Z.incurva Roxb.形成一个单系群,靴带支持率为86%;Z.jujuba Mill.和Z.acidojujuba C.Y.Cheng et M.J.Liu形成一个单系群,靴带支持率为92%。除外类群外Z.jujuba Mill.和Z.acidojujuba C.Y.Cheng et M.J.Liu位于整个系统树基部,可能是与外类群母本亲缘关系最近的类群。 4.通过对ITS和psbA-trnH序列的综合分析,结果表明:Z.jujuba Mill.和Z.acidojujuba C.Y.Cheng et M.J.Liu应该归为一个种;Z.pubinervis Rehd.和Z.apetaiaHook.归为一个种;Z.fungii Merr.和Z.apetaia Hook.亲缘关系较近;Z.incurva Roxb.和Z.mauritiana Lam.亲缘关系较近;Z.mairei Dode、Z.xiangchengensis Y.L.Chen etP.K.Chou和Z.montana W.W.Smith亲缘关系较近,三者可能起源于共同的祖先种。
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