四川骨髓库汉族人群HLA-DRB1<'*>14等位基因分布研究

来源 :中国协和医科大学 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiejie_850119
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目的:研究中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)四川分库中四川籍汉族人群DRB1*14等位基因多态性及HLA-A-B-DRB1*14 3座位单倍型分布,以便估计待移植患者在四川骨髓库中查询时,寻找到DRB1*14等位基因匹配供者的可能性及可能的错配情况。方法:四川骨髓库2004年9月至2006年5月入库四川籍汉族样本8934例,其中HLA中低分辨结果为DRB1*14组等位基因阳性的样本1449例。为保证有95%以上的把握检出其中构成比超过3%的DRB1*14组等位基因,所需最小样本量为99例。对随机筛选出的107例样本(包括2例DRB1*14纯合子),以3种不同的组特异性测序分型方案检测DRB1位点的第二外显子以鉴定HLA-DRB1*14等位基因。采用最大似然法计算8934名四川籍汉族样本的HLA—A-B-DR三座位单倍型频率及各样本可能的单倍型构成。根据样本最可能的三座位单倍型情况结合HLA-DRB1*14高分辨分型结果,推断HLA—A-B-DRB1*14单倍型,以此探讨四川籍汉族患者在四川骨髓库中寻找到DRB1*14等位基因匹配供者的可能性及可能的错配情况。结果:三种组特异性测序方案都可以获得质量良好的测序图,但都不能独立完成本研究中的测序分型工作。通过这3种方案的相互补充,完成了107例标本的测序分型。共检出109个DRB1*14等位基因,包括如下6种:DRB1*140101/1454(56.0%),DRB1*140301(1.8%),DRB1*1404(11.0%),DRB1*140501(27.5%),DRB1*140701(1.8%)和DRB1*1425(1.8%);其中3种主要等位基因构成比之和约占此107例样本的95%。本研究未检到的DRB1*14等位基因在四川汉族DRB1*14阳性个体中的频率很可能低于3%。在8934例四川汉族人群中共有3396种不同HLA—A-B-DR单倍型,其中含有DR14的单倍型125种。105例DRB1位点为杂合子的标本中发现了42种不同的HLA—A-B-DR14单倍型,并可根据DRB1*14等位基因的不同区分为66种不同的单倍型。其中比例最高的是A2-B46-DRB1*140101/1454(14/105),其次为A11-B46-DRB1*140101/1454(5/105);此外有49种单倍型只出现一次。单倍型为A2-B46-DRB1*140101/1454或A11-B46-DRB1*140101/1454的患者在四川骨髓库中找到DRB1*14等位基因匹配供者的可能性较高。供患者对的单倍型为A2-B46-DR14及A11-B13-DR14时,存在DRB1*140101/1454、1404、140501、140701 4个等位基因之间的多种错配可能,DRB1*140301、1425则根据单倍型的不同可能与DRB1*140101/1454或140501错配。结论:四川骨髓库汉族人群HLA-DRB1*14等位基因的分布比较集中,其分布特点与广州汉族类似。但该人群中同时具有极其多样的HLA—A-B-DRB1*14单倍型。根据单倍型的不同,HLA-DRB1*14等位基因间存在复杂的错配模式。
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