第一部分 乙型肝炎病毒感染结局的遗传易感性研究;第二部分 α干扰素治疗慢性乙型肝炎的药物基因组学研究;第三部分 发作性运动源性舞蹈徐动症致病基因的初步定位和突变筛查

来源 :中国协和医科大学 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sailor111
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本文研究工作分为三部分: 第一部分:目的:在一个中国家系中对PKC的致病基因进行定位并筛查突变。 研究方法: 在中国浙江收集了一个PKC家系,共16例受试者(5例患病,11例正常人)。从16号染色体上选择了9个微卫星标记,对每例受试者进行基因分型,采用linkage软件计算每个遗传标记与疾病之间的两点LOD值以对PKC致病基因进行初步定位。从定位的区域选择10个候选基因,通过PCR-测序或PCR-变性高效液相色谱(PCR-DHPLC)的方法进行突变筛查。 结果: 两点LOD值在D16S3081处(57.79CM)最大,为1.21,单倍型分析表明D16S3093/D16S685/D16S690/D16S3081/D16S3080D16S411/D16S3136/D16S3112/D16S3057这九个遗传标记高度连锁,单倍型5-3-8-3-4-2-5-5-6几乎只出现在患者中。从该区域附近选择了10个候选基因进行突变筛查:包括电压依赖的钙通道蛋白γ-3亚基(cAcNG3)、白介素4受体α基因(IL4R)、腺苷酸环化酶7基因(ADCY7)、氨基酸磺基转移酶基因(STM)、磷酸酯酶4催化基因(PPP4C)、ATP结合盒C家族成员基因(ABCC11和ABCC12)、谷氨酸盐受体离子通道型N-甲基-D-天门冬氨酸盐亚基2A(GRIN2A)、溶质载体家族6成员2(SLC6A2)和溶质载体家族5成员2(SLC5A2),未发现有意义的突变。 结论: 将PKC的致病基因定位在57.79CM~77.13CM(16p12.1-q13)之间的区域内,排除了CA(7NG3、IL4R、ADCY7、STM、PPP4C、ABCC11、ABCC12、GRIN2A、SLC6A2和SLC5A2基因作为PKC致病基因的可能。 第二部分:目的:采用巢式病例对照研究设计,以人类白细胞抗原(human leukocyteantigen,HLA)Ⅱ类基因和α干扰素抗病毒通路上α干扰素受体2(interferon αreceptor2,IFNAR2)基因和粘病毒抵抗蛋白A(myxovirus-resistance A,MxA)基因为候选基因开展干扰素治疗乙肝的药物基因组学研究。 研究方法: 以252例IFN α治疗的慢性乙肝患者为研究对象,应用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,分析IFNAR2 rs2284551 G/A、rs2248202 C/A、rs4986956 T/C和MxA-88 G/T、-123 C/A、20 C/A、rs467558 C/T、rs469390 G/A基因多态性与干扰素治疗乙肝疗效的相关性;采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法探讨HLA-DQB1、DRB1基因多态性对干扰素治疗乙肝疗效的影响。 研究结果: 1.经过3-6个月的治疗后,治疗的总应答率为69.1%,其中完全应答率16.3%(41/252),部分应答率52.8%(133/252)。 2.完全应答组和部分应答组患者基线ALT值显著高于无应答组(189.0IU/L&156.5IU/Lvs101.0IU/L,P=0.001)。完全应答者、部分应答者和无应答者问在性别、年龄和病毒基因型构成方面,均未见统计学差异(P>0.05)。 3.经多因素logistic回归分析,调整掉年龄、性别等混杂因素的影响后,DQB1<*>0501和DQB1<*>0303等位基因在应答组的频率显著低于无应答组(1.50%vs4.73%,P=0.03, OR=0.27, 95%CI=0.08-0.86; 17.07%vs26.35%,P=0.01, OR=0.55,95%CI=0.34,0.87);DRBl<*>14等位基因在应答组的频率显著高于无应答组(5.99%vs1.35%,P=0.04,OR=4.65,95%CI=1.07-20.1 6)。 4.单倍型分析表明DRB1<*>09.DQA1<*>0302-DQB1<*>0303在应答组的频率显著低于无应答组(6.89%vs14.86%,P=0.005,OR=0.42,95%CI=0.22-0.82)。 5.经logistic回归调整掉混杂因素的影响后,应答组MxA20AA的频率显著低于无应答组(10.92%vs21.79%,P=0.03,OR=0.45,95%CI=0.22-0.94)。IFNAR2rs2284551、rs2248202、rs4986956的各基因型在应答组和无应答组的频率没有显著差异。 结论: 患者基线ALT高值与对IFN α的应答相关。携带MxA20AA、HLA-DQB1<*>0501、DQB1<*>0303和单倍型DRB1<*>09-DQA1<*>0302-DQB1<*>0303的个体对IFN α治疗效果可能较差;携带DRB1<*>14等位基因的个体可能对IFN α治疗的应答较好。本研究没有证据表明IFNAR2基因多态性与IFNα治疗乙肝的近期疗效相关。 第三部分:目的:以人群为基础的病例对照研究方法,以肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor α,TNF-α)和人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-DQB1、DRB1为候选基因分析宿主遗传因素与中国人群HBV感染结局的相关性。 研究方法: 以196例慢性乙肝患者(chronic hepatitis B patients,CHB)、184例无症状慢性HBsAg携带者(chronic HBsAg carriers,CC)和143例白限性HBV感染者(spontaneously cleared subjects,SC)为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和聚合酶链反应-序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequencespecific primer,PCR-ssP)检测方法,分析TNF-α启动子区基因多态性与HBV感染结局的相关性。 在389例慢性乙肝患者、246例无症状慢性HBsAg携带者和198例自限性HBV感染者中采用PCR-SSP方法探讨HLA-DQB1、DRB1基因多态性对感染结局的影响。 研究结果: TNF-α启动子区基因多态性与HBV感染结局的相关性以白限性感染者为对照进行病例对照研究,经logistic回归分析调整掉混杂因素的影响后,TNF-α-857TT在CHB组的频率显著低于SC组(9.18%vs 17.48%;P=0.03,OR=0.48.95%CI=0.24-0.94)。TNF-α-238G/A、-308G/A、-857C/T、-863C/A、-1031T/C组成的单倍型GGCAC在CHB组的频率显著低于SC组(8.16%vs13.29%,P=0.03,OR=0.58.95%CI=0.34-0.98)。以无症状慢性HBsAg携带者为对照进行病例对照研究,经logistic回归分析调整掉混杂因素的影响后,TNF-α-863CC基因型在CHB组的频率显著高于CC组(62.24%vs 45.11%,P=0.01,OR=1.85,95%CI=1.15-2.98)。TNF-α-238G/A、-308G/A、-857C/T、-863C/A、-1031T/C组成的单倍型GGCCT、GGCCC、GGTCT在CHB组的频率显著高于CC组(45.66%vs36.14%,P=0.008,OR=1.48,95%CI=1.10-2.01;13.27%vs7.61%.P=0.01,OR=1.86,95%CI=1.12-3.10;10.71%vs6.25%,P=0.04,OR=1.80,95%CI=1.03-3.16)。 研究结论: 综合以自限性HBV感染者和无症状慢性HBsAg携带者为对照开展的病例对照研究,本研究可得出如下结论:携带TNF-α-863CC、DQB1<*>03等位基因(DQB1<*>0301/4、<*>0303)、单倍型DRB1<*>11-DQA1<*>0501-DQB1<*>0301/4是乙肝慢性化的危险因素;携带TNF-α-857TT、DQB1<*>06等位基N(DQB1<*>0601、<*>0602、半0604)、DRB1<*>13的个体在HBV感染后不易于发生慢性化。
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