加快推进薪酬制度改革是由事业单位改制为企业的科研型企业面临的首要任务之一。A院转制为A公司后，其薪酬制度改革的总体目标是建立起符合现代企业制度要求和科技型企业特点的薪酬制度，并据此确立了各类型人员之间相互区别又相互联系的系统、科学、操作性强的薪酬分配模式，即经营者的年薪制，一般管理、技术、生产人员的岗位绩效工资制，科研人员基于绩效的灵活多样的分配形式和高管、骨干人员的股权激励模式相结合的激励体系。年薪制是以企业一个生产周期，即以年度为单位确定经营者的基本报酬，并视其经营成果浮动发放风险收入的工资制度。实行年薪制后，经营者的收入主要由基薪和风险收入两部分组成。岗位工资制是按照员工所在工作岗位的不同，并根据职工完成规定的岗位职责情况，通过绩效考核后支付其劳动报酬的基本工资制度。A公司采用了以岗位要素为核心的岗位绩效系数工资制，其岗位工资的突出特点是“以岗定薪，岗变薪变”。科技劳动是一种复杂和创新性的劳动，其劳动方式灵活多样，自主性强且不易监督和计量。因此应对科研人员应实行灵活多样、针对性强和切实有效的激励模式。A公司所属二级单位中，有若干个高技术企业拟在国家即将推出的创业板上市，这类二级单位基本具备了实施股票期权的条件。个人所有的专利技术成果、非专利技术成果以及职务发明等专利权益部分持有者将其技术成果作价，认缴公司出资额，成为技术出资者,或者按国家及公司的有关规定，将所持技术成果折算为公司股份，成为公司股东。 薪酬制度改革只是企业人力资源管理体系的一个环节，必须要与岗位评价制度、业绩考核和评价体系、员工培训体系和经营者的考查、选聘的管理等改革配套实施才能取得预期的效果。