随着中药制药行业的迅猛发展，许多中药废水未经处理而直接排放。因此开展针对高浓度难降解中药废水的研究，开发工艺简单、节能低耗、高效稳定的废水处理技术具有重要意义。中药废水是一种污染物种类繁多、成分复杂的高浓度有机废水，它的生物处理技术研究大多关注在COD低于5000 mg／L、可生化性良好的易处理废水上。而哈药集团中药二厂的高浓度难降解中药废水的COD＞18000 mg／L，采用了比较先进的两相厌氧处理工艺，平均COD去除率达到了94.06％，实现了生物处理技术对高浓度难降解的中药废水处理的突破。本文介绍了哈药集团中药废水两相厌氧处理工艺，并且着重研究了哈药集团中药二厂的两相厌氧废水处理工艺的产酸相反应器和产甲烷相反应器内的微生物菌种，并进行了富集、分离、培养以及鉴定，目的是通过对两相厌氧反应器中微生物菌种特性的研究，掌握其在反应器中的作用及对反应器的影响，从而为提高两相厌氧反应器的处理效率和稳定性提供必要的参考。本文从产酸相反应器污泥中富集、分离出24个菌株，从产甲烷相反应器污泥中富集、分离出19个菌株，并对这些菌株进行了产气性能、pH和末端产物等特性的测定，最终从产酸相中筛选出第24号产酸菌，从产甲烷相中筛选出第11号产甲烷菌。通过对第24号产酸菌和第11号产甲烷菌的形态特征及其特性的测定，结果证明，第24号产酸菌的细胞为革兰氏阳性，呈短杆状，不规则，少有鞭毛，边缘不平滑，大小为2.05μm×0.6μm。个别的菌体长能达到3.64μm，生长周期为45 h。第11号产甲烷菌的细胞为革兰氏染色阳性，呈小球状，比较规则，周围光滑，无鞭毛，有些小球菌聚集呈团状菌群。大小为0.64μm×0.7μm，有些个别的球菌直径能达到0.9μm；根据对第11号产甲烷菌的形态特征的观察及其代谢底物，可以初步鉴定其应该是马氏甲烷球菌(Methanococcus mazei)；该菌株的最适温度为37℃，最适pH为7.0，生长的盐度范围为0.5％～3％，最适合生长的NaCl浓度为3％。