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建立了烟叶中25种酚类物质的高效液相色谱-紫外/质谱(HPLC-UV/MS)联合测定方法,其中11种主要酚类物质采用HPLC-UV法进行内标标准曲线法绝对定量分析,其余酚类物质采用HPLC-MS法进行内标校正半定量分析。HPLC-UV法以Symmetry C18色谱柱为固定相,流动相A为水/甲醇/乙酸(44/5/1, v/v/v),B为甲醇/水/乙酸(44/5/1,v/v/v),梯度洗脱,紫外检测波长为340nm; HPLC-MS法以Agilent SB-AQ色谱柱为固定相,流动相A为0.1%乙酸水,B为乙腈,梯度洗脱,采用电喷雾电离四级杆飞行时间质谱(ESI-Q-TOF)进行定性定量。方法验证结果表明：11种酚类标准物质在0.90-99.00μg/mL的范围内(绿原酸及芸香苷为0.95-380.00μg/mL)的线性相关系数在0.9993～0.9999之间。在22.5～24.8,45.0～49.5、67.5～74.3μg/mL3个水平的加标回收率为91.0%-112.4%。方法重复性的相对标准偏差在1.48%-13.40%之间,日内日间精密度的相对标准偏差为0.35%-15.54%。本方法已应用于批量烟叶样品检测。利用软件SIMCA-P11.5及SPSS16.0对浓香型、清香型、中间香型94份成熟期新鲜烟叶样品中的酚类物质进行了数据分析,偏最小二乘判别分析(PLS-DA)结果表明三种香型间有明显的分离趋势,其中浓香型与中间香型较接近,清香型独立分为一类；分层聚类(HCA)也得到相同的结果。两两香型通过非参数检验(p<0.05)结合PLS-DA模型的分类贡献值(VIP>1)得到不同香型间12种酚类差异代谢物。另外将酚类物质与各地的生育期气候条件做相关性分析,发现莨菪苷、芸香苷及芸香苷Ⅱ、山奈酚苷及山奈酚苷Ⅱ与生育期气候显著相关(Pearson (?)目关系数r>0.6)。研究了贵州、云南、河南的红大、K326、中烟100三个品种不同生长阶段的197份新鲜烟叶样品中的酚类物质。讨论了遗传、环境、遗传与环境互作对酚类物质代谢累积的影响。由PLS-DA得分图及酚类物质含量随生育期变化曲线看出,同一产地不同品种间酚类物质生育期累积有所不同,同一品种不同产地间的差异更大,说明环境因素对酚类物质累积的影响大于遗传因素。建立了一种酚类物质用于代谢组学研究中的新鲜烟叶样品质量判别方法。将芸香苷与山奈酚苷含量的比值作为区分代谢组学合格样品、变质的不合格样品及部分变质的不合格样品的标准,即待测样品中芸香苷与山奈酚苷含量的比值在6.4及以上的为合格样品,可用于代谢组学分析,在2.0以下的为变质的不合格样品,在2.0-6.4之间的为部分变质的不合格样品。用该方法判别了总共检测的350份样品,变质样品占8.28%,部分变质样品占6.86%,合格样品占84.86%。