母子公司以产权为纽带，以追求整体利益最大化为目的，以权力的划分为管控的核心。在企业集团母子公司管理控制体系中，母公司应利用战略管控、财务管控、人力资源管控等多种手段，通过资源的优化配置、提供多种增值服务，对子公司实施相应的管控。　　高校企业是在特定因素下的产物，为了在高校和社会间设立一道“防火墙”，高校纷纷设立控股公司或管理本部，代替高校统一行使出资人权利，并对高校产业和国有资产进行管理和监管。但这种“先有儿子，后有老子”的产生方式，使控股公司或管理本部在对产业集团子公司的管理控制职能日益力不从心，具体表现为：产业集团没有完善的母子公司治理结构，集团内部存在功能较差和缺失，子公司自主经营、独立管理，子公司间信息沟通不畅，导致重复劳动、管理费用浪费，甚至同业竞争，集团管控问题亟待优化。　　论文研究按照母子公司管理控制相关理论的指导，结合作者近7年来在清华产业从事母子公司管理的实践经验，较为深刻的剖析了清华产业集团在母子公司管理控制方面存在的问题，针对清华控股本部的组织结构优化、在产业集团整体运营管控上存在的不足，提出了优化方案。