加工番茄是普通番茄的一种,可作为原料来制作番茄酱、番茄汁等产品。我国是世界第二大加工番茄生产基地,有40多年的产业发展历史,制品以番茄酱为主,还有切块、晒干、整装等加工制品类型,随着栽培技术的进步,生产上需要有更多类型丰富的加工番茄新品种来实现品种的更新换代。但我国在加工番茄新品种选育方面还存在种质资源遗传基础狭窄,抗性难以突破,优异种质资源少等问题。因此,对现有加工番茄种质资源进行深入挖掘和研究,有利于提高育种效率,选育出更多遗传背景丰富、农艺性状优良的品种,推动新疆加工番茄产业的稳健发展。本文选取石河子大学加工番茄课题组保存的35份加工番茄种质资源,利用SSR分子标记和形态学标记技术对35份加工番茄种质进行遗传多样性分析,明确其亲缘关系,筛选出综合性状优良的种质资源,为新品种选育中亲本的选择选配提供理论依据。该研究主要得出以下结论:1.通过分析35份加工番茄的27个农艺性状得到:不同材料,不同性状之间有很大的差异。本研究中各表型性状变异系数均在10%以上,平均变异系数为26.2%,各性状多态性显著,其中番茄红素含量的变异系数最大,为72%,首花序节位的变异系数最小,为10%。通过综合评价,筛选出了综合品质前五的加工番茄种质材料,这五份种质分别为DG-8、DG-6、JY-3、WS-2和JY-1。2.根据相关性分析结果发现:果实硬度和番茄红素含量、首花序节位呈极显著负相关,果型指数与心室数呈极显著负相关,与果实硬度、果实横径呈极显著正相关,可溶性固形物含量与可溶性总糖含量呈极显著正相关,单花序果数与单花序花数呈极显著正相关。3.各性状进行主成分分析,对各个主成分解释的百分比进行统计,前10个主成分累计贡献率达到78.21%。因此,本试验进一步提取前10个主成分作为新的指标,用来替代27个性状指标,建立回归方程,简化计算过程,有利于后续研究。4.利用形态学数据进行聚类,在遗传距离10处可将参试种质区分为4大类群。类群I包含12份种质材料,以早熟种质为主,叶片形状多为普通类型,果实横纵径较大,果形指数较高。第II类群包含了13份种质材料,主要以大果型为主,果实成熟色多为红色,硬度适中,番茄红素含量高,可溶性固形物含量较高,可滴定酸含量较低。第III类群仅有3份种质材料,番茄红素含量较低,果型指数较小,接近圆形,果实硬度较大,可溶性固形物含量较低。第IV类群有7份种质材料,单花序果数较多,结果集中。5.利用SSR分子标记,从100条随机引物中筛选出10条多态性高、条带清晰的引物,10对引物共扩增出61条谱带,其中多态性谱带51条,多态率高达83.6%。利用Pop Gene32软件计算各种质间的Nei遗传距离,其范围为0.10～0.85,用Power Marker软件所得数据生成35份加工番茄种质的系统聚类图,由聚类图可知,可将35份加工番茄种质分为五大类群。